突变在儿童期脑瘤识别新方法

成神经管细胞瘤是儿童最常见的恶性脑瘤。它通常在小脑,即使发展现代治疗改善了预后70%以上生活5年多,并不是所有的患者是可以治愈的。侵略性的癌症治疗也会导致严重的副作用,如平衡问题和学习能力受损在癌症幸存者。

大量研究探讨了不到百分之二的人类DNA产生蛋白质,和更少的了解其余的基因组。癌症,如成神经管细胞瘤,因此98%的突变发生在少研究基因组的一部分。可能有成千上万的突变,很难单独开车从那些没有癌症的重要性。

获得一个全面的视图的突变成神经管细胞瘤是很重要的,研究人员使用他们最近开发的一个方法,作为一个国际财团的一部分。方法专门看着基因组中守恒的位置,和建立在保持不变的假设dna序列经过数百万年的进化可能有重要的功能。

“在新的研究中,突变成神经管细胞瘤患者相比,信息如何一个人在基因组中的位置一直在进化。突变的地区几乎没有变化可以认为是最重要的,”Ananya罗伊说,研究员和共享这项新研究的第一作者。

我们在145年发现的200 000个突变患者中,共有114个突变被发现在基因组保守立场。许多这些基因突变发生在以前没有报道突变在癌症,尽管一些基因的改变成神经管细胞瘤中蛋白质含量。新发现的突变位于DNA包含有关,说明当多少蛋白质。因此结果可能解释成神经管细胞瘤早期观察不同的蛋白质含量。

“我们专注于突变保存最完好的立场,因为这些可能最关键的基因调控。这样我们可以找出最重要的突变,否则不可能,然后测试其功能”,Karin Forsberg-Nilsson说,领导这项研究的研究人员之一。

研究人员发现不同的变异在不同年龄段和不同子组的成神经管细胞瘤,而突变改变了成神经管细胞瘤细胞中基因表达文化。

“这表明我们的方法,可以提供一个清晰的这些突变如何调节蛋白水平在癌细胞”,委员Kerstin Lindblad-Toh说,他也领导了这项研究。

在这项研究中,研究人员发现也表明,突变的新方法修改了癌症细胞的抗癌症药物。这个分析突变的新方法可以因此建议个人治疗,所谓的精密医学。

这意味着病人的特定突变模式用于选择一个药物影响的基因突变的个体,是越来越多的用于癌症治疗。

然而,对于这个工作,必须有一个已经存在的药物,可能用于另一种疾病,可用于治疗一些癌症患者“突变”。这项新研究可以扩大治疗的突变的数量,从长远来看,给更多的个性化治疗方法提供给病人。

“能够使用精密医学癌症突变分析,很多关于每个病人的遗传信息是必要的。因为所有儿童脑肿瘤在瑞典现在提供全基因组测序分析,即整个肿瘤基因组映射,有好的发展可能性分析进一步Forsberg-Nilsson说,受益的病人”。

参考:科济列夫SV,罗伊,Sakthikumar年代,小说等。使用进化的约束来定义候选司机在成神经管细胞瘤基因。PNAS。2023;120 (33):e2300984120。doi:10.1073 / pnas.2300984120

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