PNAS文章验证BioMark™数字阵列用于从单个干细胞分析转录因子

研究发表于美国国家科学院院刊表明BioMark™数字阵列，结合PCR技术，为基因调控网络的研究提供了一种新的工具。

在这项研究中，数字阵列被用于在每个细胞的绝对拷贝基础上量化基因，从小鼠骨髓中提取的五类造血干细胞前体。

结果表明，常见髓系祖细胞的基因表达模式存在差异，家政转录本GAPDH存在显著差异。

这种分歧强调了测量单细胞转录本的必要性，以便清楚地了解细胞编程。

“我们相信数字阵列技术将对干细胞研究的步伐产生重大影响，”该报告的作者之一、斯坦福医学院弗吉尼亚和路德维希癌症研究临床调查教授、干细胞生物学和再生医学研究所所长欧文·韦斯曼博士说。

数字阵列有可能克服在微孔板平台上实施PCR分析所固有的困难。

传统的mRNA检测涉及对大量细胞的聚合测量，这可以掩盖决定细胞命运的关键调节状态。
另一方面，数字阵列用于分析单个细胞。它的工作原理是将样品和检测成分的混合物分配到大约1000纳米体积的反应室中。

芯片的结构，以及适当稀释样品的加载，确保每个腔室包含一个或没有拷贝的目标基因(cDNA)。

在芯片热循环之后，只有基因阳性的腔室才会发出荧光信号，这使得特定细胞的拷贝数能够被准确计数——即数字PCR。