了解蛋白质可以推动多种癌症类型的生长

科学家们已经完成了一个深入分析的蛋白质驾驶跨多个肿瘤癌症类型,信息不能单独评估基因组测序。了解蛋白质在肿瘤细胞培养新疗法的前景块驱动肿瘤生长的关键蛋白质,或治疗触发免疫反应异常蛋白质由癌细胞。

由圣路易斯华盛顿大学医学院,麻省理工和哈佛,杨百翰大学和其他机构在世界各地,肿瘤临床蛋白质组学分析协会调查的关键蛋白质驾驶癌症和它们是如何监管。

研究成果刊登在8月14日一组论文的期刊细胞和癌症细胞。

临床肿瘤蛋白质组学分析联盟由美国国家癌症研究所资助的国家卫生研究院(NIH)。

“在我们努力开发更好的癌症治疗,这种新的分析驱动肿瘤生长的蛋白质是下一步癌症基因组测序后,“资深作者说李丁博士史密斯,大卫英语杰出的华盛顿大学医学教授。“通过我们过去的癌细胞的基因组测序工作,我们确定了几乎300个基因驱动癌症。现在,我们正在研究机械的细节这些癌症基因启动——蛋白质和监管网络,做的工作造成不受控制的细胞分裂。我们希望这种分析将作为一个重要的资源寻求开发新疗法的癌症研究人员对许多肿瘤类型。”

研究人员分析了大约10000个蛋白质参与了10个不同类型的癌症。丁强调的庞大数据的重要性在这种类型的分析;许多这些重要cancer-driving在任何单一蛋白质是罕见癌症和不可能被确认有肿瘤类型单独研究。分析包括两个不同类型的肺癌和大肠癌,卵巢、肾、头部和颈部,子宫,胰腺癌、乳腺癌和脑癌。

“许多这些蛋白质驾驶的癌症被发现在多种肿瘤类型但在低频,”丁说,也是一个研究的成员斯特曼癌症中心巴恩斯医院和华盛顿大学医学院。“当我们一起分析许多癌症类型,我们增加功率检测重要的蛋白质,是导致肿瘤生长和扩散。综合分析还允许我们确定的主要常见的机制推动跨类型癌症。”

除了个别蛋白质的功能,这样的数据也让研究人员了解蛋白质相互作用促进肿瘤生长。如果两种蛋白质的水平与另一个——例如,当一个人出现在高水平,另一个总是——这表明,两种蛋白质可以作为合作伙伴。干扰的交互可能是一个有前途的方法来阻止肿瘤的生长。

研究,其中包括共同丁和迦得斯坦利博士Broad研究所,还显示不同蛋白质可以改变它们的功能发生了化学反应。研究人员记录这样的化学变化过程称为乙酰化和磷酸化-可以改变DNA修复,免疫反应变化,和修改DNA是如何折叠和包装,以及其他重要的分子变化,可以玩角色在推动癌症。

研究还揭示了免疫疗法的有效性。免疫疗法如检查点抑制剂通常工作最好在癌症的突变,但即便如此,他们并不适用于所有的病人。研究人员发现,大量的变异并不总是导致大量的异常蛋白质,也就是免疫系统攻击肿瘤时的目标。

“对于某些癌症,甚至突变有可能生成肿瘤抗原,如果没有异常蛋白质的表达,或很少,这种突变可能不是通道治疗,”丁说。“这可能是一个原因为什么有些病人不应对免疫疗法,即使看起来他们应该。因此,我们的蛋白质组学研究覆盖肿瘤抗原的表达谱是特别有用设计新免疫疗法针对选定的突变。”

在另一项研究中,丁的团队发现的DNA甲基化模式,另一个化学变化可以影响基因表达的方式。这样的模式可以癌症的关键因素。在一个重要的发现,研究小组发现了一种分子开关,抑制免疫系统在某些肿瘤类型。

的期末论文的四个研究的数据和分析资源使用的财团可以更广泛的研究团体。

“一般来说,这种彻底的蛋白质组学和化学改性分析在许多癌症类型-结合我们长期癌症基因组学的知识提供了另一层的信息,我们希望可以帮助回答很多关于癌症生长和持续的问题设法逃避我们的许多最好的治疗方法,”她说。

Yize Li博士,现在前博士生和博士后在丁的实验室,是第一作者的两个文件,一个关于致癌司机和其他关注的数据和资源。wen wei梁博士过去前博士生和博士后叮的实验室,是本文的第一作者专注于DNA甲基化;和Yizhe歌,叮的实验室目前的博士生,co-first作者是关于转录后修饰。马修·h·贝利博士前博士生叮的实验室,现在杨百翰大学助理教授,是一个co-first作者对致癌司机在纸上。

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