与变革性力量发射timsTOF超质谱仪的灵敏度,300 Hz PASEF MS / MS, VistaScan™为增强dia-PASEF®4 d-proteomics™
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在71年的圣asm会议,力量公司(纳斯达克:电流断路器)宣布变革4 d-proteomics敏感性timsTOF与此同时,博姿公司推出了新的平台timsTOF超质谱仪。它包含一个新的俘虏喷雾电离(CSI)超离子源与更大的毛细管和优化涡旋气流,小说4th代蒂姆斯(困离子流动分离)XR细胞和14位数字转换器。的timsTOF超55岁以上可以识别k肽,映射到5000蛋白质组在单细胞水平0.125 ng装载时,罗斯福在1%,超过4800个蛋白质组量化的CVs < 20%。这一突破性的敏感性和定量性能低于1 ng蛋白质负载设定了新的基准水平。无与伦比的敏感性,证明timsTOF平台的健壮性,和现在PASEF责任周期为MS / MS 300 Hz,为超低样本数量提供了重要的进一步的性能改进,包括无偏单细胞蛋白质组学和单细胞lipidomics,无偏空间蛋白质组学,immunopeptidomics phosphoproteomics,天车分析和蛋白质交互(PPI)的研究。
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免费订阅费边Coscia博士组长马克斯·德尔布吕克中心空间蛋白质组学,柏林,德国,说:“单细胞敏感性dia-PASEF工作流上timsTOF超带来了我们的低投入组织蛋白质组学研究提高到一个新的水平。使用20分钟nanoflow LC梯度结合力量优化dia-PASEF窗口(3×8)方法,我们现在可以量化地1500 - 2000激光micro-dissected老鼠肝脏FFPE组织的蛋白质只有1500µm2,对应区域大约1 - 2肝细胞。”
这些timsTOF超取得了进步的前提下高通量蛋白质组学的优秀的鲁棒性,例如,每天50个样本(SPD),甚至到398年社民党,也不是最高的< 1%肽鉴定信心和< 1%的蛋白质罗斯福(错误发现率),避免了大的目标免疫识别方法。
教授卡尔Mechtler,蛋白质组学在分子病理学研究所的创新中心(IMP)孟德尔研究所(GMI)和分子生物技术研究所的奥地利科学院(拜仁),补充道:“要真正理解细胞机制和疾病,关键是区分各种细胞类型。而单细胞分析已经改变,我们面临障碍的潜力最大化吞吐量和蛋白质组分析。这将使生物检测单细胞实验6000或更多的蛋白质。的timsTOF超克服这些障碍,让我们探索单个细胞的蛋白质组在速度和无与伦比的敏感性。多亏了timsTOF超单细胞分析已经达到了新的高度,我很兴奋地看到,这个突破将会引领我们下一个。”
力量还引入了VistaScan软件同步商旅坡道与四极扫描进一步受益于离子流动信息的规模。这个复杂的动态linked-ramp支持小说midia-PASEF模式,引入的Stefan Tenzer (doi.org/10.1101/2023.01.30.526204)。
Stefan Tenzer博士教授定量蛋白质组学和女士的核心设施,美因茨大学,评论道:“我们实验室专注于定量蛋白质组学方法要求最高的灵敏度和最高的信息提取。加上力量,我们开发了这部小说最大的信息dia (midia) PASEF扫描采集模式提供data-independent收购(dia)的敏感性,同时将数据转换为视收购(dda)——如光谱。immunopeptidomics midia-PASEF潜力和phosphoproteomics尤其令人兴奋。”
力量有独家授权midia-PASEF从美因茨大学和计划发布midia-PASEF在2023年作为一个产品。的timsTOF超配备所需VistaScan收购的能力。
此外,timsTOF超功能进一步改善dda-PASEF收购模式,增加速度为18000到300赫兹碰撞截面(CCS)启用MS / MS谱使深入每分钟4 d-proteomics和4 d-lipidomics / 4 d-metabolomics几分钟很短的LC梯度。
俘虏喷雾电离(CSI)超
力量的CSI超离子源,关键nanoflow敏感性最高,进一步优化了timsTOF超通过集中涡nanospray技巧来提高离子传输气体。涡确保电离在梯度50 - 5000 nL /分钟的流量。
Christof楞兹博士的核心功能蛋白质组学在哥廷根,夏洛蒂说:“安装新CSI的来源变得更简单,我们现在可以随便交流列和发射器,在相同或更好的性能。此外,这部小说用螺钉固定的设计提供了发射器定位和调整而不需要手动调整。我喜欢它,重要的是,技术人员在我的实验室做的!”
微流Higher-Flow 4 d-proteomics发射器
力量的成功VIP-HESI离子源现在配备了新的微流排放功能。这使得有效电离在微流分析LC流量,利用超高灵敏度,timsTOF平台的健壮性和速度。
Johanna Tushaus博士工业实验室慕尼黑技术大学说:“大脑计划大规模蛋白质组学的项目,我们需要一种快速、敏感、女士和健壮的质/设置。耦合通过我们完善的微流LC技术VIP-HESI源的timsTOF HT被证明是一个强大的组合。它使深蛋白质组使用短梯度覆盖,从而连接速度和灵敏度。的发展50µm ESI发射器是提高灵敏度的关键微流LC timsTOF设置。”
成员Mukul闵毅达博士,博士,研究员莫里茨实验室,系统生物学研究所,西雅图,还说:“进行大规模的定量蛋白质组学,它高度稳定的电喷射条件至关重要。的力量VIP-HESI源提供了复杂的等离子体样品的重现性。源连接简单,容易的参数优化,喷雾稳定是一流的。这些改进样品处理量增加,达到100%的正常运行时间,且稳定,精确量化的蛋白质。”
实时质量控制能力力量ProteoScape软件Biognosys红外热成像设备
力量介绍4 d-proteomicsProteoScape增强软件实时分析与质量控制(QC)使用新功能Biognosys红外热成像设备。工具包包含十一个原子能合成肽,为稳定、灵敏度、保留时间间隔,CCS-enablement以确保最佳的系统性能实时监控。
负责人爱德华多博士Chicano-Galvez IMIBIC质谱和分子成像单元,雷纳索非亚医院,西班牙的科尔多瓦大学说:“质量控制(QC)模块实时监控,确保我们的平台进行得很顺利,和宝贵的临床样品不会丢失。我们现在能够从样本结果大样本临床蛋白质组学项目在很短的时间内,保持敏感,鲁棒性、可追溯性和分析质量。”
的力量ProteoScape软件还集成第三方工具,包括BPS Novor包快速,精确,和准确的从头测序immunopeptidomics meta-proteomics,典型的特定酶乳沟信息不可用。所有现有的力量不是软件升级用户将提供力量ProteoScape。
SCiLS实验室集成MetaboScape®注释Multiomics空间生物学
SCiLS实验室2024现在包括代谢物和脂质注释利用MetaboScape注释,以及改善CCS-enabled 4 d找到加速multiomics空间组织生物学特性。SCiLS实验室2024提供了一个集成multiomics工作流,结合谱HiPLEX-IHC蛋白质与脂质分析,代谢物和多糖分析相同的组织,包括auto-segmentation和统计分析。
艾琳·h·斯利博士,博士,质谱影像设备主管,化学系,德克萨斯大学奥斯汀分校,说:“这部小说4 d功能找到SCiLS实验室专注于我们CCS-enabled MALDI成像研究的相关信息。这大大加速我们的影像工作流和女士可以有效地评估组织样本。融入SCiLS实验室使它比以往更容易得到的timsTOF fleX”。
MetaboScape 2024现在还支持半定量分析利用稳定isotopically标记脂质标准和集成的质量规范查询语言(MassQL),代谢组学的领域特定语言驱动的社区。
OligoQuest™2.0软件增加功能定制的寡核苷酸的修改
OligoQuest 2.0的新版本提供了增强的RNA和寡核苷酸序列特征使完整的产品确认(FLP)以及侧产品完整的质量和MS / MS分析。此外,OligoQuest解决方案确认修改的RNA序列和异构寡核苷酸的交流基地。客户可以定制自己的寡核苷酸的“字母”表示标准或定制修改。
Fritz Schweikart博士制药开发/阿斯利康,哥德堡,评论道:“与OligoQuest我们终于长手等评价工具,极大的简化了,如果不使我们能够深入分析MS / MS数据从我们的制药反义寡核苷酸(ASOs)。可以分析化学降解现在安逸和手动MS / MS数据是历史的调查。的用户交互测试beta版本是非常容易和简单的对复杂的质量匹配算法在后台发生的。”
