MetaboScape——提供一个新图层的洞察力发现代谢组学

发现代谢组学研究工作流需要快速精确的能力和自信地识别相关标记群复杂的混合物。通过使这些工作流并提供选项来使用路径映射设置结果在生物环境中MetaboScape是互补的数据Brukers LC-QTOF-MS /女士,磁共振质谱(mrm)知识。

数据预处理是一个重要的步骤在一道代谢组学提供对统计结果的信心。缺失值可能会导致假阴性结果在统计数据评估,真正的差异存在于数据没有突出显示的是不同的。的T输入法设置一致再保险祗园完成eX牵引(霸王龙)算法提取所有相关信息,自动和“区域完成”的方式。群LC-QTOF-MS /女士属于同一个数据集离子化合物结合,所有样品和自动对齐re-extracted最初在单个样本如果低于峰值选取阈值因此解决统计数据的缺失值问题。

图1:霸王龙算法自动重新校准质/ MS数据从力量QTOF工具(1)。随后霸王龙结合离子属于同一个复合成一个特性,即同位素、充电状态、加合物或片段(2)。非线性保留时间对齐确保数据一致性在大群LC-QTOF-MS数据集(B 1)。跨多个样本特性提取“地区完成”解决“价值观”缺失的问题后续统计分析(B 2)。

自动和自信识别已知的化合物完全理解至关重要的生物代谢组学数据的上下文。图形注释质量“AQ”表示允许分析师容易评估的可靠性在MetaboScape每个注释自动生成匹配的保留时间,准确的质量,同位素模式信息,MS / MS谱库光谱根据用户可定义的阈值水平。

图2:图形注释质量“AQ”符号使分析师容易评估他们的信心在自动识别化合物

MetaboScape还支持流动注射(FI)或MALDI -磁共振质谱(mrm),两个革命极端质量分辨率技术,使高吞吐量分析复杂代谢提取样本。直观的工作流程评估这LC免费提供化合物不易解决的数据补充质分析。

图3:的示意图表示FI / MALDI-MRMS工作流支持MetaboScape 3.0: A) LC自由mrm收购;B)创建一个特征矩阵,特征包括假定的分子的分子离子和isotopologues伪;C)分子式注释列表,包括注释品质得分;D)统计分析(例如PCA)来识别感兴趣的特点;E)假定的结构注释基于独特的分子式。