分解的分子变异在人类诱导多能干细胞

诱导多能干细胞(iPSC)越来越多地用来模拟人类疾病等位基因功能的影响。人类诱导多能干细胞项目(www.hipsci.org)是生成一个参考面板的iPSC行一起丰富multi-omics表型数据从500年500名健康的个人和个人选择的罕见疾病,将用于研究团体和行业。迄今为止,HIPSCI生成和表型640的高质量iPSC行220人使一个全面调查万能的变异和异质性的来源。在这里,我们描述的初始分析基因组、表观基因组、转录组和蛋白质组的IPS行健康个体由HIPSCI生成的。尽管一个广泛的文献在万能的遗传和表观遗传异质性,生成的线我们已经有显著的基因和epigenetically稳定。我们使用一个方差分量分解方法行之间的分子变异的来源,发现基因的影响可以可靠地检测到一系列分子和细胞化验,并经常解释大幅变化比许多其他技术和生物因素,包括细胞培养条件下,供体性别、年龄和组织的起源。我们首先研究地图的表达在万能和连接这些数量性状的数据从其他体细胞组织和疾病有关的变异。值得注意的是,我们还确定基因变异影响复制行之间的异质性,这在一定程度上可以解释为交互(GxE)与已知的细胞环境(增长媒体)和状态(多能性)。最后,我们研究遗传和非遗传因素如何影响细胞生长速率等关键“诱导多能性”细胞属性和分化能力。我们预料HIPSCI所产生的线和数据都将形成一个宝贵的资源,为人类疾病的未来研究和发展。