用安捷伦的SureSelect DNA捕获阵列补充下一代测序技术

大规模并行DNA测序技术在基因组生物学和医学中具有至关重要的意义，因为它们有可能对遗传变异进行全面和系统的评估。目前，这些测序技术主要面向全基因组测序。要更广泛地采用这些技术，需要一种比pcr更具成本效益、具有更高通量和更大通用性的方法，例如目标富集，对多个离散的感兴趣的基因组区域进行定向重测序。为了验证安捷伦DNA微阵列用于目标富集的使用，安捷伦与Greg Hannon博士的实验室(冷泉港实验室)合作，捕获了与乳腺癌测序研究相关的外显子区域。我们以0.025%的人类基因组为目标，使用安捷伦244K 60 mer探针阵列捕获大约1287个离散的基因组区域。
捕获的DNA随后被释放并进行测序。测试了各种杂交条件，最终在目标区域内获得了2700倍的测序reads富集。该系统被认为是有效的，测序读取覆盖了99.8%的目标区域，98%的目标碱基至少有一次读取，标准化的平均每碱基读取深度为27 / 100万32碱基读取。这些结果证实，安捷伦DNA微阵列可以为感兴趣的基因组区域的靶向测序提供快速有效的解决方案。