大麻实验室能帮COVID-19测试积压?

今年1月21日,第一个来自中国武汉病毒的基因组序列,被称为SARS-CoV-2 COVID-19的病原体预印在bioRxiV。不到24小时后,纠正和改进的版本是相同的网站上发布。有一些传言的时候这种病毒是有多厉害,当然,但这是前所未有的。科学是系统的,缓慢的。你不要放弃新的结果,然后第二天修复它们。这不是这是如何工作的。这是很多人在科学界并不直接参与流行病学或病毒意识到有东西坏了。

第二天美国生物技术信息中心翻译,和重新翻译,成蛋白质的基因组序列信息。无聊,我把这些序列并组装成一个文件以正确的格式,用于蛋白质组学软件和文件新闻在蛋白质组学研究,一个网站我运行在很大程度上使质谱的模因。第二天,我感到震惊的观点我的网站收到的数量。这是当我意识到一些很坏的来了。

那个周末我把这些蛋白质序列,通过质谱对它们进行计划,包括一个新的深度学习计划,提出了一些理论方法检测患者样本中的病毒。这是一个有趣的运动,我们学习了一些新的工具,这就是我和我的朋友们做一些周末,然后我们坐在它。

来吧,什么是两个质量spectrometrists会导致一些病毒?这是一个疯狂的想法,在最好的情况下,我们会像我们抓住头条新闻。有基因组学专家和流行病学家和美国疾病控制中心(CDC)和世界卫生组织,他们会得到这个。为什么我们需要提出不同的东西吗?

你知道这个故事。检测试剂盒的问题。试剂短缺。我有一个规则对任何想法。我把这个想法和我谈论它,聪明的人,鼓励他们拍摄下来。我很幸运朋友比我聪明,我的很多想法就此止步。这个没有因为这个疯狂的想法看起来会比没有想法。最后,在一个月后我们完成了,我们把预印本我紧张地等待一个响应。清除和快速发布和八天后是我最看的东西写在15年的职业生涯写太多。

“疯狂的想法1号”突然没有那么的地方与我们周围的世界发生了什么。与传统系统的压力下分解这一前所未有的全球大流行,是时候击倒墙壁和思考科学和诊断以一种新的方式?

我们的小团队的目标是建立新的仪器应用的设备,人们已经有了。我们工作的原则,任何一块下分析设备,特别是质谱仪,可以改装到做任何事情如果你足够有创意。Covid-19仅仅是一个新的挑战在我们从事的长队。在这一个,只是更高的股权。

在我们的研究中我们提出这个想法:“嘿,如果你没有访问Covid-19测试装备,但你有进入质谱仪,你可以使用它,这是方法你需要这五个不同品牌的乐器。”和文章结尾的邀请与我们联系寻求帮助。和人做的。一天没有了,我还没有联系到某人在实现这些化验工作。

疯了吗?是的。这是一个未经验证的方法创建完全由计算机程序和事情是如此糟糕,人们不得不试一试。

它变得更疯狂。测试的积压仍然是可怕的。今天不管你在哪里。是的,有乐观的理由的新测试标题和它会变得更好,但是现在的正在增长。

坐在电话会议与一些政府科学家从一个广泛的机构,有人提到一个笑话之类的,大麻是什么实验室,他们有很多的乐器…“我们大笑,然后停止了笑。大麻合规实验室有正确的工具。

我们修改过大麻行业在过去一年左右的时间。我们设计、构建和验证实验室2019年在马里兰和我们实验室设计是复制,只是今年早些时候在加州进行验证。我们学到了很多关于大麻产业和人民,但仪表都是相同的。相同,我们过去用于系统炭疽和癌细胞和病毒。

的检测化验SARS-CoV-2有两种主要类型。到目前为止,最常见的,包括那些由CDC使用定量聚合酶链反应(qPCR)工具。几乎所有的大麻测试实验室使用相同的硬件测试微生物病原体。我估计这个数字根据访问几十个实验室在北美,但我猜,80%的大麻实验室在美国使用药物基因组学qPCR化验。这些化验使用的硬件相同的仪器用于CDC化验。事实上,我正在咨询在琼斯镇珊瑚礁实验室的建设,PA,我们甚至发现很难获取工具。制造商难以跟上需求Covid-19化验。

第二种类型的分析是基于蛋白质。抗体是针对SARS-CoV-2蛋白质和这些化验可以更便宜,更快,但更敏感。需要很长时间来生成抗体,但这些应该很快就会冲击市场。在临床实验室几乎每年都另一个基于抗体的测定是取代了更快、更敏感、更可再生的化验由液相色谱-光谱法(LCMS)。

每一个大麻合规实验室在北美LCMS。这就是力量往往是决定,总是有产品农药污染和生长调节剂的筛选。一些实验室甚至利用LCMS萜烯含量的测定。LCMS对于所有这些事情,这也是对监测病毒多肽在人体体液。杜克大学的研究人员一直在开发病毒化验LCMS平台上至少十年,他们不是唯一的。SARS-CoV-2并不特殊。一旦你有了目标,你可以检测病毒蛋白质或多肽,或人类的蛋白质形成的病毒。连同我们的预印本资源提供测试SARS-CoV-2感染使用海域,安捷伦,日本岛津公司、安捷伦、热工具。

我们不是第一个提出这个想法。3月27日,加拿大卫生部已经接近大麻测试实验室是否他们可以帮助测试积压。我们没听过更多,但问题几乎在每一个诊断技术是一样的:谁来开发试验和培训技术人员如何执行它。

这是一个不靠谱的想法:我们会的。我们开放的想法。我们需要帮助和实验室感兴趣或需要转移资源从测试大麻筛查病人SARS-CoV-2可以联系我们。我们会尽我们所能。我们也兴奋地写资助找到资金来吸引更多的资源的情况下变得更糟,我们不得不转移资源从许多实验室这个努力。

摘要:发展中Covid-19我停了好几次,因为我想我是疯了。我完成了讯问。如果你在一个领域没有足够的测试,也许是时候去大麻实验室。他们有合适的设备。他们有训练有素的工作人员。某些地区可能会关闭这些有价值的实验室。如果你需要帮助,向我们伸出援手。我们会尽我们所能。我希望我们永远不需要去这么远,和这个想法只是一个备份计划永远不会被使用。

在这个危机时刻,既定的计划没有采取足够的措施。也许是时候疯狂的想法。这是我的不靠谱的想法。

本杰明Orsburn是蛋白质组和基因组科学的首席科学官。