EPIC-XS财团开始

欧洲财团提供蛋白质组学基础设施(EPIC-XS),资助作为地平线2020工作计划的一部分,2019年4月25日至26日在阿姆斯特丹召开启动会议。这次会议聚集了世界领先的欧洲的蛋白质组学专家组成的一个财团支持优秀的生命科学研究的共同目标在欧洲。代表所有18 *参与成员国,从年轻科学家到蛋白质组学专家,有机会相遇在一个轻松的和非正式的场合和讨论重要问题与欧洲相关的指导方针。

“阿姆斯特丹的启动会议绝对是很棒的从一个年轻的科学家的角度。一方面,它解决了行政问题公共访问欧洲最好的蛋白质组学设施,同时也给当地的研究活动的一个很好的印象不同的合作网站。现在,我急切地等待着第一个访问项目到达我们的网站。”- - - - - -Florian拜耳,博士后学生,德国慕尼黑工业大学。

为科学进步铺平了道路,然而,可以证明具有挑战性。幸运的是,其中的一些挑战以前在欧盟资助的蛋白质组学模仿PRIME-XS,结束在2011年运行了四年。这一行动是成功的努力把蛋白质组学社会连在一起作为一个更加协调的科学蛋白质组的努力。不幸的是,它的可持续性是短暂的,它没有充分处理的问题在国际上建立一个更统一的蛋白质组学平台。

为此,EPIC-XS财团已经在一个成功的公式,随着社区扩大财团包括七个新欧洲伙伴。因此,跨国访问所有生命科学研究者最先进的蛋白质组学设施也已从6个地点在EPIC-XS PRIME-XS 11个站点,提供大约2400天的可访问性的蛋白质组学技术和进入其无与伦比的经验。

启动会议开始的简要介绍教授Albert见鬼、项目协调员和乌得勒支大学的生物分子质谱和蛋白质组学教授,谁解释项目的起源,从2017年成立,开球和项目在2022年12月完成。他演讲的本质体现了所有成员的确定提供并满足当前要求进入世界领先的设备和技术,这样在蛋白质组学开放全新的视角。

而资金可能会自生自灭的2022年底,蛋白质组学的可持续性社区,通过这一行动,在今后相当长的时间里将继续巩固和发展。这一目标是可以实现的可能觉得该财团成员的传染性的热情骄傲地展示最先进的技术和专业知识在他们的机构。

虽然这个项目是高度赞赏,像最雄心勃勃的项目并非没有挑战。然而,区别是,许多教训,汲取了PRIME-XS作为来自Raijmakers(组长,研究支持办公室,乌特勒支大学),解释道。开展试点研究的重要性不能被强调,节省宝贵的时间和精力,并确保申请人的期望是现实的。开放获取是关键,是强化了教授克丽丝Gevaert从弗兰芒Instituut voor Biotechnologie (VIB,根特)在演讲,不仅对跨国访问,在允许提交在全国范围内,以及在国际上,而且对确保所有出版物都是免费在线。

开放获取的数据也解决的灵丹妙药ESFRI社区。这种生物蛋白质组学财团由EPIC-XS伙伴教授胡安·安东尼奥·防御率(蛋白质组学团队领袖EMBL-European生物信息学研究所,英国)教授奥利弗Kohlbacher(德国)埃伯哈德卡尔图宾根大学教授Lennart Martens(VIB,根特)和开赛的前一天,讨论“蛋白质组学隐私:鉴定风险在临床蛋白质组学数据和对蛋白质组学数据管理”。

会议构成第一步公开讨论和文档有关临床蛋白质组学数据隐私问题,一个著名的主题研究人员处理DNA / RNA序列数据。然而,只有最近,类似的担忧已经开始出现在蛋白质组学领域。最近一些有关执行欧盟的总体数据保护监管方针,记录了2018年5月。随着蛋白质组报道,对个性化搜索蛋白质组数据库和容错数据库搜索,变种确实可以经常被发现在蛋白质组水平。其他数据类型也有可能是patient-identifiable,如翻译修饰(天车)概要文件和蛋白表达水平。因此,当前的政策全开数据共享在美国和欧洲可能需要修改。

这个项目的抱负在克服挑战再次反映在令人印象深刻的尖端联合研究活动(JRA)在第二天。四个JRA的:

• “计算蛋白质组学和Cross-Omics集成Lennart Martens教授提出的(VIB,根特)
  
  
• “未来和新兴的蛋白质组学技术,”了茱莉亚Chamot-Rooke教授(巴斯德研究所、法国)
  
  
• “平移蛋白质组学”提出的关联Maarten Altelaar教授(乌得勒支大学)
  
  
• “蛋白质组组织结构和空间蛋白质组学”了教授亚历山大•莱特纳(乙,瑞士苏黎世联邦理工学院)

是建立在该财团成员的极强的创新业绩,重点是设计新方法未来的发展努力计算和结构蛋白质组学以及解决更具挑战性的主题包括单细胞蛋白质组学、交联质谱,高阶组织蛋白质组,multi-omics集成,本机蛋白质组学,平移/临床蛋白质组学和个性化/精密医学。这些JRA还将解决后勤障碍产生的大量数据集,通过蛋白质组学方法可以生成。

“很高兴成为熟悉EPIC-XS社区,有这么多的专业知识我们期待导致显著的进步在蛋白质组学的研究中,“- - - - - -夏绿蒂施博士SciLifelab,斯德哥尔摩,瑞典。

蛋白质组学社区也将受益于该领域的专业知识通过培训课程和研讨会。第一个车间,一起组织2月在染色质蛋白质组学,希腊将在今年9月。可以找到更多的信息在这里。

EPIC-XS财团成员可以感到自豪,他们与欧洲共同努力,如果启动会议的承诺的蛋白质组学专家,那么全球生命科学研究有一个非常明亮的和可持续的未来。

提交,可以找到更多的信息在这里。

“欧洲的启动会议蛋白质组学基础设施财团提供(EPIC-XS)汇集了欧洲最好的蛋白质组学实验室和研究人员。有一个非常积极的气氛和感觉的共同承诺给欧洲带来先进的蛋白质组学研究社区。我特别喜欢的是重点与目标很明确,那就是共同研究活动,开发最佳实践和协议,以实现整个访问网站,提供跨国访问所有欧盟内部人员和相关的国家。”- - -丹麦哥本哈根大学教授Jesper奥尔森。

*财团成员:巴斯德研究所、法国(IP);瑞典皇家理工学院(k),基础研究和技术海勒斯,希腊(出来);苏黎世联邦理工学院(ETH / FGCZ);德国慕尼黑工业大学(TUM);挪威卑尔根大学(UIB);爱沙尼亚塔尔图大学(UT);丹麦哥本哈根大学(UCPH);弗兰德生物技术研究所,根特(VIB);欧洲生物信息学研究所、英国(EBI);研究所的分子病理学、奥地利(IMP); Utrecht University (UU); European Institute of Oncology, Italy (IEO); Institute of Microbiology, Czech Republic (IMIC/CEITEC); University of Cambridge, UK (UCAM); Spanish National Cancer Research Centre (CNIO); Centre for Genomic Regulation (Spain) (CRG); Eberhard Karl’s University Tübingen, Germany (EKUT).