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把鱼带入21世纪

乳腺癌细胞染色体的不稳定。来源:国家癌症研究中心/托马斯·里德

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今天的细胞遗传学实验室正在受到挑战优化试剂和劳动力成本以及减少试验时间通过使用更高效的技术。为了解决这个问题,BioDot——全球领先的高通量超低容量分配系统——正致力于开发下一代的细胞遗传学改造荧光原位杂交(鱼),一个关键的分子细胞遗传学技术。

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最近采访了布莱恩·柯克BioDot业务发展副总裁,以了解更多关于鱼,其优势和应用程序。在这次采访中,布莱恩也突显出新技术是解决一些经典的局限性鱼将这项技术带入21世纪。

安娜·麦克唐纳(AM):你能提供一个概览的鱼和一些应用程序是用来做什么的?

布莱恩·柯克(BK):
细胞遗传学分析样品用于识别的检测和研究染色体异常遗传病,血液疾病和癌症。荧光原位杂交,确切地说,是一个尝试和测试细胞遗传学技术,可视化和映射在细胞遗传物质。鱼用荧光探针目标特定DNA序列检测已知的基因改变通过标准实验室方法。与鱼,科学家可以检测基因异常包括删除、复制或易位。它还可以执行染色体“绘画”,它使用多个荧光体检测染色体重排。由于其简单性和可靠性,鱼是许多生物标记物的选择工具评估和监测疾病进展的关键平台在癌症。研究人员还依赖鱼帮助进一步我们的整体了解疾病的生物学。

问:为什么技术这样一个流行的诊断工具吗?

汉堡王:
鱼是非常具体、准确,可以用于各种各样的协议选择和样品类型,包括血液、骨髓和实体肿瘤。因为鱼是一种主要的细胞遗传学实验室,有大量的现有的知识已经出现在实验室里,一个健壮的供应链所需的试剂和建立工作流已经到位。鱼在实体肿瘤的使用是特别有益的,因为它保存组织的完整性。用新技术代替鱼,像下一代测序(门店),可以是一个昂贵和复杂的任务,涉及引入新的工作流和招聘bioinformaticians能够分析大量的数据。此外,许多这些新兴技术与周转时间更长更复杂的协议,而鱼可以执行一个相对较短的周转时间。这些障碍是禁止许多实验室鱼仍然是细胞遗传学的黄金标准,持续改进。

问:哪些局限性传统与技术相关的?

汉堡王:
鱼一般都以手工、实践方法处理和分析样本。鱼DNA探针相当昂贵的试剂,特别是当使用供应商推荐每张幻灯片的试剂。许多实验室正在寻找机会自动化这个过程增加吞吐量提高生产力,质量和成本效益,在使用更少探测器每样额外储蓄。然而,新技术可以解决这些挑战巩固鱼的黄金标准细胞遗传学检测和疾病研究中受益。

问:新技术改造技术和如何帮助克服这些问题?

汉堡王:
最新的鱼技术引入了标准化、自动化和微型化提高实验室效率和吞吐量,同时降低成本。

在BioDot,我们已经开发出一种更有效率,鱼多路复用平台。使用非接触式和定量液分配技术使小型化和自动化准备幻灯片,我们能够分配只与精度,增加流体在玻片更快,而不需要用户的监督。它使高度可再生的化验与八个人多路复用每张幻灯片杂交领域。这个地址很多低效率的经典鱼通过使较小的样本大小的可靠测试,减少昂贵的荧光探针的体积要求从10毫升/测试只有0.5毫升/样本和产生更少的块玻璃来处理和分析。减少探针使用导致显著节省实验室,由于探测器使用的最高成本占鱼。

这改善了鱼方法可用于处理各种矩阵,稀释或浓缩样品自动打印到幻灯片之前,允许更大程度的标准化。再现性的增加使可靠分析的自动化,使用一个自动荧光显微镜进一步减少周转时间。一个内置的条形码阅读器意味着每个样品仔细追踪在处理,使样品管理更容易和更有效。这种独立于供应商的方法验证了大多数常见的鱼类调查供应商是否有各种不同的探针集。临床诊断实验室已经开始采用这种转变,我们称为细胞遗传学2.0。

问:细胞遗传学将来我们能期待什么?多大的角色将会替代技术,如上天玩?

汉堡王:
实验室诊断过程很少是单一应用程序,而是互补的研究提供一个完整的病人的病情。虽然替代方法像上天肯定是有价值的诊断工具,鱼仍然是一个黄金标准诊断由于易于使用和执行当天的能力研究样本收到结果。自动化的鱼减少调查卷和更少的动手时间将有助于不断扩张的鱼在临床和研究实验室进行测试,最终推动更好的病人结果。

布莱恩·柯克安娜·麦克唐纳说,科学技术网络作家。188金宝搏备用

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安娜·麦克唐纳
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