阴道微生物的基因目录
来源:Charles Deluvio on Unsplash
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近年来,对人类微生物群的研究出现了爆炸性增长。
微生物组是指微生物群落,包括真菌、细菌、病毒、噬菌体和原生动物,它们共同生活在一个栖息地。例如,这个栖息地可能是肠道、皮肤或生殖器。
在这一领域的研究增加,导致承认微生物组有助于人类的健康和疾病状态。然而,这一贡献背后的机制尚不明确,科学家们正在探索中。
对科学家来说,了解哪些微生物生活在土壤上很重要健康的身体,以及哪些微生物可能致病。从身体的一个区域到另一个区域的微生物的异质性使得很难构成什么是“正常的”微生物组。基因组学在这方面提供了帮助,因为基因测序提供了特定样本中存在哪些细菌群落的快照。bet188真人
阴道微生物群
临床感兴趣的一个领域是以阴道为家的微生物群落。这种微生物群的遗传和功能多样性对科学家来说仍然有些难以捉摸。到目前为止,研究表明“最佳”阴道微生物群落由一种或多种细菌主导乳酸菌,包括crispatus, L. gasseri而且l . jensenii据信会产生乳酸,有助于阴道内的酸性环境,防止感染。然而,还需要进一步的调查。
现在,来自马里兰大学医学院(UMSOM)基因组科学研究所(IGS)的研究人员已经创建了 处女座 (人类阴道无冗余基因目录):第一个阴道微生物组的基因组目录。
VIRGO已作为公共资源发布,科学家可以利用它探索微生物在妇科健康状况中的作用。它的发展在由Bing马博士,IGS微生物与免疫学系副研究员,可在 自然通讯 .
Ma说:“VIRGO的价值在于,它既是一个中央仓库,也是一个高度可扩展的工具,可以快速、准确地描述阴道微生物群。”
更进一步的好处是VIRGO是用户友好型的。Ma补充说:“VIRGO对于计算技能有限的用户特别有用,他们想要分析大量的测序数据,并且只能使用有限的计算基础设施。”
该目录包含近100万个基因,每个基因都标有携带该基因的细菌名称及其功能。处女座背后的科学家假设它含有阴道微生物群中95%的基因。
探索与阴道相关的病理
VIRGO的实用性在对超过1500个阴道宏基因组的分析中得到了证明,这揭示了占据阴道的细菌是更多的不同于以往的想象,这表明女性携带着自己的“个性化”细菌。
“这一发现是一个改变范式的发现,因为它使该领域摆脱了单一菌株的想法乳酸菌负责一个最佳的微生物群,”说 雅克·拉威尔博士 微生物学和免疫学教授,IGS副主任和高级科学家。
IGS研究人员的下一步工作包括进一步探索阴道微生物群在阴道病、性传播疾病以及早产等疾病中的作用。
UMSOM院长说:“UMSOM的教师正在进行重要的努力,将我们对人类相关微生物群落日益增长的理解转化为临床生物标志物和治疗方法。bet188真人 E. Albert Reece,医学博士,工商管理硕士 他也是马里兰大学医学事务执行副校长,John Z.和Akiko K. Bowers特聘教授。“这项开创性的研究为解决女性关键健康问题的研究人员提供了强大的、公开的工具。”
Ma et al.(2020)。一个全面的非冗余基因目录揭示了人类阴道广泛的群落内种内多样性。自然通讯。DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-14677-3 .
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