自动化可以帮助抵抗疾病如何
将自动化纳入病理学工作流可能会使更快和更准确的疾病诊断。我们赶上了科尔曼Stavish Proscia Inc .首席技术官提供商的数字病理工作流,讨论这些好处如何变化,前方仍障碍重重。
Ruairi Mackenzie (RM):如何帮助对抗主要疾病自动化?
科尔曼Stavish (CS):自动化的应用在医学承诺两件事:帮助解决供需问题在病人护理和帮助来提高诊断的准确性和一致性。中国有14亿人,约20000许可的病理学家。与美国相比,同样数量的病理学家的人口不到四分之一的中国,不同的是惊人的。
具体来说,在解剖病理学,在癌症诊断中发挥着不可或缺的作用,有许多领域自动化的深思熟虑的应用可以帮助病理学家和病人一样。例如,免疫组织化学(包含IHC)是一大块个性化医疗的“难题”,然而病理学家的解释包含IHC幻灯片往往手册,费力,和非标准化。图像分析应用程序可以自动细胞计数和罕见的事件的检测,如有丝分裂,病理学家可以花更多的时间在更高级的诊断决策,同时提高诊断和预后的准确性。
在医学实验室的其他地方,我们看到几乎二十年前,自动化是通过细胞病理学。创新在这两种样品制备(例如ThinPrep)和自动或半自动计算机检测系统产生了巨大的效率提高,同时提高医疗服务的质量。
RM:这场战斗是一个经常大规模作战,由全球团队在许多不同的实验室。如果一个实验室在这种合作采用智能工作流,破坏与实验室合作不会拥有这样的创新?
CS:如果有的话,一个实验室采用数字病理通常作为其他实验室采用数字病理的催化剂。主要原因是世界上可以看到数字实验室看到供应商承诺的好处,以及一些额外的好处,他们可能没有预期。第二个原因是数字采用由实验室管理需要仔细规划。看到另一个实验室过程首先允许后续实验室学习从任何错误和更有信心他们过渡。
在病理学实验室之间的合作通常需要协商的形式,指组织发送的幻灯片和大sub-specialist专业咨询机构。的标准操作程序发送咨询联邦快递,你不能得到任何比这更低技术!邮寄样本始终是一个选择(至少在国内咨询),但随着实验室采用数字成像功能,我们将会看到越来越多的电子咨询被发送。
病理实验室增加数字足迹,不同系统之间接口将成为比以往任何时候都重要。每个人都知道如何处理航运的接口和接收一个联邦快递包。但一个实验室的数字病理系统能够与另一个实验室的系统?它是至关重要的,供应商负责购买者互操作性的问题。
RM:有多容易实验室采用智能工作流?Proscia简化这个过程如何实现无缝安装吗?
CS:将数字病理实验室操作比人们想象的更为复杂。实验室工作流产品年的逐步优化;改变它们的前景让许多人感到不安。的可能性大,前期成本(一个小实验室可能产生15 tb的每月数据)没有帮助。Proscia的解决方案解决这两个问题。首先,我们的软件可以配置多个不同的用例和工作流,使实验室选择只有一个或两个地区试点数字。这使实验室人员得到舒适的修订工作流程通过渐变和生产力。第二,Proscia利用亚马逊网络服务,微软Azure和阿里巴巴云为实验室提供可伸缩的,现收现付制存储基础设施。当你储存骨干是全球领先的安全,兼容存储你的数据可能是比它将住房本地安全。也就是说,许多机构政策cloud-averse, Proscia还支持部署客户拥有的基础设施。 Additional lab concerns revolve around interoperability. For example, “I have two scanners from two different vendors, can one software system read both file types?” or “I am heavily invested in my anatomic pathology laboratory information system (APLIS)-- can my digital pathology system interface with it?” Proscia software is compatible with all the major file formats (vendor-agnostic) and supports integration with existing LIS and EMR systems.
智能工作流可能会看起来像这样:乳腺病理标本进入一个实验室。组织是固定的,嵌入式,和最初的圆)的幻灯片准备,像往常一样。而不是那些幻灯片直接病理学家,他们扫描算法预测是否需要任何re-cuts或包含IHC染色。如果是的,这些额外的幻灯片可以马上做好准备,然后病理学家可以有完整的诊断和预后评估所需补充的幻灯片。这可以等同为实验室更快的周转时间,没有算法干预,标准的工作流病理学家检查第一个圆)的幻灯片,然后手工订单额外的污渍。这可能需要一天或更到,推迟最终病理报告。
Proscia使实现工作流无缝,通过自动加载图片的张幻灯片扫描仪(任何供应商)和通过与解剖病理学实验室信息系统(APLIS),通常管理命令,报告和其他实验室的日常任务。
RM:告诉我们关于数字病理。有数字技术推进病理学研究的例子吗?
CS:这是一个非常激动人心的时刻是在生物医学信息工作,特别是在项目使用张幻灯片的图像。一个多世纪,病理学家看着组织准备通过光学显微镜玻片上。幻灯片上的视觉模式的组织非常有意义,他们告诉病理学家一个病人是否患有良性炎症或致命的癌症。然而,我们能从这些模式的数量是有限的人类专家,一个研究的主要瓶颈。张幻灯片图片一样,包含组织的载玻片扫描分辨率高,创建一个图片一样清楚的人会得到在显微镜下观察。作为组织样本作为数字图像捕获,他们可以通过专门的计算机算法分析详尽的细节,发现全新的相关性和见解,逃脱了几十年来人类眼睛的注意。