新的RNA提取策略帮助缓解短缺SARS-CoV-2 PCR组件

惊人的努力由政府、居民、医疗保健和必要的工人,和研究人员,第一波的新型冠状病毒出现(在撰写本文时)在很大程度上平息了整个欧洲。当然,这并不没有巨大的牺牲和损失。虽然第一次被打了,我们准备我们希望不会发生什么事,但不得不计划nonetheless-second波。不幸的是,已经有证据表明欧盟第二波安装在一些地区。大多数,如果不是全部,北半球是准备迎接新的激增的天气变化在未来几个月。

科学家们有他们的工作为他们自2019年底以来,当SARS-CoV-2病毒第一次出现。在全球范围内,他们竞相开发准确的测试方法,这是一个重要的工具在抗击病毒的传播。广泛测试允许隔离和接触者追踪事件的积极成果,以及监控重启进程,这在许多领域已经开始。

在短时间内测试的研究已经取得了很大的进步。两个主要方法被用来检测新型冠状病毒:血清学和聚合酶连锁反应(PCR)。多年来,PCR的黄金标准识别各种病毒和细菌,像市场上最高的敏感性和特异性。SARS-CoV-2病毒也可以通过PCR被认可,一直是一个重要的研究工具几乎在每一个国家受到COVID-19的影响。

提取是一个重要的PCR的整体工作流程的一部分,因为它的功能是分离出病毒RNA从许多其他生物组件鼻swab-derived样本。在提取过程中,样品被蛋白酶,经常蛋白酶K消化任何蛋白质。重要的是,它还防止核酸通过核酸酶降解。从样品提取后,收集到的RNA用于存在包,反转录转换RNA和DNA。特定的引物对用于放大DNA,和荧光信号可以发现如果探测器能够绑定到一个指定的序列。

由于持续不断的大流行在许多地区,有不仅需要扩大规模,但维持率indefinitely-because,出现了前所未有的个人资源用于病毒研究的需求。提取工具是一个重要的组成部分,蛋白酶K近几个月一直供不应求,这影响了扩展的过程。

解决一些蛋白酶K的短缺,一些研究人员开始调查,利用工作流没有RNA提取阶段。这种策略通常是不谨慎,因为protocols没有重要的步骤可以有较高的失败率,污染物质,称为PCR抑制剂,仍然在示例。离开了提取通常导致更多的假阴性,这不利于有效地跟踪病毒的努力。此外,尽管人们可能会认为,成本可能是保存在没有RNA提取方法,可能需要的测试可能会抵消任何储蓄。最后,测试需要qPCR组件可能自己很难。

更有价值的策略是保持提取步骤和设计新的有效成分站在那些供不应求。贝克曼库尔特生命科学开发这样一个策略:我们的团队发现一个补充协议的现有研究基因组提取试剂盒也可以用于新型冠状病毒的RNA提取。

该方法使用的为撒顺bead-based技术。过程的实质是:衣壳是细胞溶解后,RNA是固定在磁性粒子。应用程序的磁场还允许的污染物分离出来,然后使用一个简单的漂洗掉洗程序。因此,该策略允许临界萃取步骤保持,没有使用蛋白酶K,没有额外的假阴性的风险。

阿拉巴马州亨茨维尔iRepetoire独立采用的方法研究三天,他们执行100 RNA提取超过500 qPCR反应。结果是鼓励和建议的方法是一种有效的提取使用蛋白酶K的替代品。

最近几个月,我们有高档工作值得注意的是,通过重新分配资源原材料和劳动力,大大增加了提取设备制造能力。仅在3月,这些努力导致增加10倍RNA提取设备生产。一个全球分布的努力使得包可用于高通量实验室在全球范围内,大大缓解紧张的供应系统。

美国食品和药物管理局(FDA)包括提取方法FDA的FAQ页面上用于疾病控制和预防中心(CDC)紧急使用授权(欧洲大学协会)授权COVID-19测试。

作为世界上继续战斗在大流行,发展创新的策略来扩大提取的可用性,和任何其他测试组件,正面临供应问题,将是一个持续的需求。研究人员之间的协作和组织都是这项工作的基本要素,和应该培养他们往往导致更有创造性的和有效的解决方案。识别新型冠状病毒的存在会特别重要,因为第二波threaten-fast和重复测试内部和社区之间将精确定位的一个重要组成部分,解决这些波前增加太高了。bet188真人