下一代蛋白质组学技术使科学家能够获得更全面的蛋白质组的分析,可以更深入地理解复杂的蛋白质网络和通路参与生物过程。这种增强知识拥有巨大的潜力来阐明疾病机制,发现药物靶标和确定生物标志物,这可以导致改进的诊断,治疗和个性化医疗。
蛋白质组学作为基因组学提供的静态信息”可能是什么,”上下文的理解发生了什么细胞。瑞士Biognosys专门从事下一代蛋白质组学解决方案设计将研发、临床试验和临床决策。公司开发的这些解决方案提供多维蛋白质表达见解,功能和结构在行业领先的速度和规模在所有主要的生物物种和样本类型。
188金宝搏备用奥利弗rin博士说,Biognosys的首席执行官和创始人之一,了解该公司已经证明的能力质谱分析(女士)的蛋白质组学在药物开发和探索,以及为什么他觉得这个行业对女士已经达到了临界点。
凯伦管家(KS):在蛋白质组学最新进展是如何影响Biognosys和已被大多数变革?
奥利弗rin(或):过去十年的巨大进展分析功能是通过改进仪器,样品制备的协议,在很大程度上,通过先进的软件。之前,只能抓女士从力学上看表面,不能访问相关的低丰度蛋白质或修改,甚至细微结构的信号。
现在,我们看到一个加速提高技术性能,由新的物理方法如力量的离子迁移技术和基于人工智能的算法,使信号检测性能,曾经遥不可及的经典方法。这些进步奠定了蛋白质组学在全球范围内访问。
授权研究、药物开发和临床决策、新技术创新使蛋白质组可操作的。例如,Biognosys label-free发现蛋白质组学工作流(超级反应监测或人力资源管理™技术)使完整的蛋白质组分析在数据独立收购(DIA)的蛋白质量化工作流程,提供非常高的蛋白质组报道在许多生物样品中可再生的和精确的量化。
KS:你最近推出了Proteoverse™,你能告诉我们更多关于这个工具,为什么它是以及它如何可能帮助科学家开发的吗?
或者:Biognosys,我们相信深蛋白质组的见解的关键突破发现变换科学更好的生活。Proteoverse提供直观和互动数据可视化蛋白质组学数据的可获得性,并确定可行的生物标志物和生物制药研究生物的见解更容易。它的目的是使研究人员能够深入挖掘数据,识别潜在的相关模式,与已知的机制和制定新的假说以迭代的方式。
Proteoverse提高可访问性丰富的数据和提供了一个广泛的直观和互动的数据可视化和探索功能。因为我们是一个多提供原始数据,我们的服务包括蛋白质组学数据的援助专家可以处理数据集的复杂性和判断分析特定结果的有效性。客户可以获得更多的数据快速、轻松地提取有价值的生物的见解。这将使他们进步的研究发现最有趣的分析物的成千上万的蛋白质,探索他们的肽水平结构和研究生物相关性。该工具将提供与Biognosys的研究服务。
我们相信Proteoverse汇集专业技能的能力和分析知识在人类交互将使研究人员能够使用数据以一种有意义的方式。推动人类之间的相互作用,我相信,最有效,最令人满意的方式推进科学。
KS: Proteoverse可能帮助尤其是肿瘤空间?
或者:大多数研究人员疲于应付来自组学数据集数据溢出。基因组学数据相比,这种复杂性的数据在多维领域更为明显的蛋白质组学研究。蛋白表达的变化,蛋白质只修改或影响地址子域所有可能相关。同时,肿瘤学研究发现深疾病——或者pathway-specific——知识重要的蛋白质。所以,我们有丰富的功能相关数据一方面满足深癌症通路另一方面科学知识。这就是为什么我相信可能说明小说的功能蛋白质组学与癌症通路已有知识见解Proteoverse推进肿瘤学研究有着巨大的潜力。
此外,在肿瘤组织样本也常见,这些样品工作特别好女士组织标本提供更高浓度的生物标志物在病理过程的位置,比如癌症,而在周边血液浓度较低。他们也允许捕获和描述病变组织之间的蛋白质表达水平的变化,如肿瘤,和相应的健康组织。剖析法我们组织磷酸化蛋白质组服务提供深入、定量见解激酶、磷酸酶和癌症细胞信号级联工作,揭示药物发现的新目标。
Biognosys Indivumed,精密肿瘤学专家,最近在合作重大的一个项目涉及大规模蛋白质组分析结直肠癌患者活检和健康组织的控制。超过900的组织样本进行了分析,每种情况下利用只有5 - 10毫克的组织。分析过程检查超过7000蛋白质和20000 phospho-peptides。通过整合这一综合数据集与Indivumed multi-omics数据库,新颖的见解关键分子和临床上重要的信号通路与结直肠癌的生成有关。这些发现可能会推出新的治疗靶点,为进步在精密医学治疗结直肠癌。
KS:关于什么是最让你兴奋的当前轨迹Biognosys的作用在癌症研究中,治疗和诊断发展?
或者:最让我兴奋的是蛋白质组学越来越不仅仅用于执行一些黑盒大数据研究,但理解生物机制,从而直接影响药物开发。在这个意义上,蛋白质组学成为高度并行化生物化学。我从根本上相信只有生物机制的理解可以推动生物学的进展。然而,经典的细胞生物学有一个太窄对这些机制的看法。
例如磷酸化,许多出版物关注单个phosphosite,这给人造成的印象,蛋白质有几个重要phospho-switches二进制的方式行动。通过执行全球phospho-proteomics,我们看到一些蛋白质有几十个phosphosites,显而易见,磷酸化的想法作为二进制开关不能通常是正确的。我们需要新的mechanistical模型的磷酸化信号理解更广泛的作用。
另一个激动人心的可能性是使用女士在结构研究。结构是蛋白质功能的终极动力。使用有限的蛋白质水解技术发明的教授Paola Picotti在苏黎世瑞士联邦理工学院苏黎世联邦理工学院,现在专门许可和Biognosys进一步发展,我们可以开始调查与药物和蛋白质或蛋白质之间的相互作用。
除了分析技术维度,MS-based蛋白质组学的发展向临床应用有望使早期研发之外的影响。蛋白质组学分析允许访问的机械化相关药效学生物标志物。蛋白下降的领域提供了一个女士的当前利用蛋白质组学分析的例子,我们最近在临床试验中采用有针对性的分析。
KS:技术正在迅速推进,可以打开很多研发机会。然而,它也可以是一个挑战为研究小组获得潜在的昂贵的设备评估和决定最佳投资时间和金钱。你觉得你们这样的公司可以帮助解决这个问题吗?你认为共享技术中心可能是一个发展方向吗?
或者:我们从一开始就认识到,科技发展和影响科学和医学的进步,需要访问。通过发布、教学和蛋白质组学提供我们的软件的用户,我们已经在移动领域扮演重要角色从高技术,主要访问、专家技术广泛使用在学术和工业实验室。
与此同时,我相信,蛋白质组学从根本上不同于基因组学由于其更高的复杂性,因此它不会遵循相同的轨迹的下一代测序实验室可以由非专业人员。因此,研究人员访问的能力领先的蛋白质组学作为一个端到端的服务,包括数据分析,仍将是我们的使命的一个重要组成部分提供获得蛋白质组学和功能,影响科学。
我期望我们将会看到越来越多的实验室执行内部蛋白质组学在某种程度上为额外的能力但将依靠合同研究组织或获得方法,像immunopeptidomics,他们可能没有设置内部。我们公司可以帮助,使研究人员能够获得更多的质谱仪,同时给予他们选择使用我们的专业知识进行蛋白质组学研究。
奥利弗博士rin卡伦博士是管家,高级科学技术网络作家。188金宝搏备用
