新一代测序诊断实验室的进步

越来越多的临床实验室采用下一代测序(上天)在诊断,由于测序技术成本下降和强大的生物标志物,可以从一个生成测试数据。

然而,尽管重大进展在图书馆准备包、一个门店运行可以证明劳动密集型即使最熟练的技术人员。此外,实验室,新门店,建筑所需的技术技能和熟练程度达到一致的和可重复的结果需要大量的时间。

安捷伦科技正在努力增加门店在诊断领域的实用程序和个性化医疗。我们最近采访了朗达·艾伦,安捷伦科技公司的研发主管,了解更多关于两个安捷伦最新的产品在这个空间,癌症一体化(AIO)板,马尼总会在图书馆准备系统。

莫莉·坎贝尔(MC):为什么我们看到下一代测序的增加使用个性化医疗(上天)作为诊断工具吗?

朗达·艾伦(RA):概要文件的能力很多生物标记在一个门店测试有可能同时回答很多问题。这种能力是非常有益的临床空间时间和组织切片是珍贵的。与测序成本不断下降,总会变得更具成本效益比传统的多通道连续分子测试方法。

主持人:科学家们面临的挑战是什么时候进行挥动图书馆准备?请您能告诉我们如何马尼总会在图书馆准备系统开发来克服这些挑战呢?

类风湿性关节炎:与门店库准备工具的进步,即使在今天的协议仍然需要全天或变速过程由技术熟练的技术人员和劳动密集型的。实验室新门店,它需要大量的时间和投资建立这样的专业知识,特别是在临床设置。甚至有经验的实验室技术员可以看到相当多的变化生成的库使用手册协议分析的复杂性。马尼挥动准备系统是一个自动化系统设计尽量减少手动步骤,可以引入污染和处理变化。马尼需要最少的员工和专业知识。安捷伦提供条形码pre-aliquoted试剂,和车载向导用户通过设置在5分钟。这个系统允许总会天真的用户和实验室化验开始运行快速、重复性良好。

MC:越来越多,我们看到了实验室自动化系统总会在图书馆准备。这是为什么和如何马尼总会在图书馆准备系统帮助促进研究这些团体?

类风湿性关节炎:随着越来越多的实验室采用门店进行测试,测试的体积增加,变得有运营效率目标的关键。因为捷库准备是一个时间和技能密集型过程,设计良好的自动化是关键。马尼旨在运行准备过程完全离开的方式。也许最有效的利用马尼是技术员加载系统在一天结束之前。准备完成一夜之间没有干预。技术专家可以进行下一个步骤。一些自动化解决方案需要技术专家经常使用设备和监控进展以保证重现性。马尼提供所需的一致性和操作效率是完全走自动化解决方案。

司仪:安捷伦如何马尼挥动准备与其他安捷伦产品系统集成来实现一个高效的挥动工作流?

类风湿性关节炎:马尼已经是一个系统集成的安捷伦的解决方案——从内置热循环能力一次性打包SureSelect图书馆准备和hybrid-capture试剂。此外,SureSelect酶破碎设备完全兼容作为上游过程剪切的DNA。当运行完成后,马尼8-well图书馆和QC条可以放置4150年TapeStation评估质量的库。一旦完成测序,我们Alissa对齐和打电话解释生物信息学系统优化分析SureSelect库。

司仪:安捷伦的癌症一体化(AIO)面板使体细胞的高灵敏度检测单核苷酸变异,indels,基因拷贝数异变和易位在一个试验。这是如何做到的呢?

类风湿性关节炎:这种性能是通过结合创新的探头检测算法设计方法和先进的变体。AIO面板有鱼饵为特定的变异类型,有针对性的设计;新AIO CNV算法解决体细胞CNV的挑战使克隆CNV检测样本中含量较低的肿瘤。检测易位是通过序列的捕获和识别跨基因融合点。这种方法提供了健壮的易位打电话无论易位的伙伴。

主持人:AIO面板支持低投入的DNA和FFPE样本。为什么这个特性有利于现代肿瘤学的实验室?

类风湿性关节炎:在当前的标准实践,临床样本保存formalin-fixed,石蜡包埋(FFPE)组织,从而维持细胞形态组织学检查了几十年。然而,这种保护将会伤害到我们的DNA,使它具有挑战性的下游分子检测。作为临床活检越来越微创,从手术活检组织的数量越来越小。因此,它是至关重要的,一个门店技术肿瘤实验室执行从FFPE强劲和少量的DNA样本。

MC:安捷伦如何设想马尼挥动准备系统和癌症AIO面板产品推进个性化医疗领域,特别是在癌症吗?

类风湿性关节炎:对抗癌症是一个受益更多的研究者和临床医生加入战斗。第一,这是使通过一个强大的技术像挥动可供任何实验室运行。上天最大的新贵之一是图书馆准备,马尼是自动化的解决方案,处理和传递一致的结果。第二,这个领域需要强大的分析提出正确的问题。SureSelect一直在图书馆准备和内容选择的前沿新AIO功能提供对专家和新手都先进的检测能力。我们设想,许多肿瘤学专家——而不是仅仅挥动的专家——现在可以利用安捷伦的马尼和AIO技术推进更好的健康结果。

朗达•艾伦研发负责人安捷伦与莫莉坎贝尔说,科普作家、技术网络。188金宝搏备用