解决SARS-CoV-2变异的传播

全球公共卫生组织和领导人采用不同的方法对病毒跟踪与监控停止小说的传播SARS-CoV-2变体。英国的新“测试和序列”战略要求所有国际旅行者的“红名单”国家检疫十天进入英国,进行PCR测试天两名。任何积极的样品然后寄给政府认可实验室的基因组测序。这样一个实验室Oncologica。

直到最近Oncologica专注于提供精密肿瘤检测和肿瘤样本的分子分析。现在,其对抗COVID-19领导人之一,在800000年进行诊断测试。

188金宝搏备用跟马可Loddo博士联合创始人和科学主任Oncologica Gareth Williams和MBChB,博士联合创始人兼医学主任Oncologica了解实验室枢轴COVID-19测试,情况与新兴小说变异和测序在全球范围内的重要性。

安娜·麦克唐纳(AM):病毒变异如何出现?

加雷斯·威廉姆斯(GW):病毒的自然进化和变异,以优化它们的生存机会。去年B.1.1.7变体时第一个特征约26个突变。现在我们31 - 36突变。随着疫苗越来越普遍,越来越多的人免疫,选择压力驱动这些新兴变异将会增加。

问:为什么它这么重要的跟踪和监控这些突变?

马可Loddo (ML):关键是检测突变病毒的任何变化可以产生很大的影响在其传播性和致病性。这些变化也使它不太可能对现有疫苗能识别病毒并触发免疫反应来对抗。

同样重要的是,测序提供了完整的病毒的方法报道,随着新突变可能分布在病毒的基因组的任何地方。一些化验只覆盖50%的基因组,但是你需要完全覆盖整个签名。我们选择了离子Ampliseq SARS-CoV-2研究小组分析样品使用下一代测序(上天)因为SARS-CoV-2面板覆盖超过99%的基因组,包括所有血清型。

问:你能告诉我们更多关于英国的“测试和序列”战略和目标?

ML:英国开始了“测试和序列”战略,防止新的潜在vaccine-resistant菌株,扩散进入这个国家。这个新计划可能是最强的方法保护新变体的边界问题。

根据规定,所有国际旅行者从政府认为是“红名单”国家必须检疫后10天到达,然后进行pcr测试第二天和8。同样重要的是要知道打PCR是不再允许新的到来测试;测试需要多路复用,以确保它可以接新变种。最后,如果旅行者测试阳性样本必须被发送到一个政府认可实验室的基因组测序。

问:Oncologica一直支持测试工作在大流行,首先COVID-19测试和最近SARS-CoV-2测序。什么使你扩展你的门店测序能力从现在的癌症肿瘤的分析还包括SARS-CoV-2和你是怎么实现的变化?

温伯格:八年前我们建立Oncologica专注于精密肿瘤学和药物基因组学。我们的兴趣在于应用基因组测序识别患者更容易应对靶向疗法、免疫疗法。

当大流行,我们首先开始使用COVID测试的实验室,以便它可以为我们脆弱的免疫功能不全的癌症患者。从那里,我们被邀请参加在英国国家测试程序。我们开始测试最弱势群体在社区里,然后扩展我们的测试程序,包括学校,和最近开始支持企业、工厂、大学和医疗机构覆盖一个大型社区的一部分。目前,我们的COVID测试能力使我们每天处理大约35000个样本。

到去年年底,政府引入了测序所有传入移民的概念,以防止扩散的新变种,我们开始研究使用我们的门店体验SARS-CoV-2测序。我们推出COVID-19测序计划3月1日,预计体积增长越来越多的人开始旅游在整个夏季和锁定限制放宽。

问:测序的水平每箱国与国之间的显著变化。为什么它是重要的全球扩张测序?这是如何实现的呢?

ML:我们学会了变异迅速可以跨越国界,常常未被发现,与无症状的个体。当我们谈论的疫苗,我们谈论接种整个世界与全球计划。测序将会采取同样的方法,是一个全球测试计划能够有效地检测和跟踪新兴株之前成为人群中流行。

随着越来越多的人重新开始国际旅游,测序项目需要防止新的暴发新变种。英国的程序是非常重要的,我希望它将会继续,而其他国家现在将开始更多的与测序。每个国家都应该有自己的测试和序列策略是唯一的方式保护社区免受变体周游世界。bet188真人

问:除了跟踪变量,其他角色可以测序在流行什么?

温伯格:测序的上下文中也很重要监测疫苗效力和开发新的、有效的疫苗。整合将是很重要的信息,如t细胞剧目和b细胞剧目在疫苗和抗病毒药物的发展,和下一代测序将是这一战略不可分割的一部分。

此外,在大流行期间癌症患者不幸遭受缺乏治疗和访问。因此,我认为我们将看到一个晚期癌症患者疾病的发病率增加在未来几个月和年。需求增加,我们可能会看到一个癌症基因测试来确定突变,可以与响应性的靶向治疗。

问:你认为将来使用的流行影响了测序项目公共卫生吗?

ML:排序是一个保护自己免受未来的大流行的一部分。它不仅仅是能够识别病原体也决定个人最危险。免疫特性是非常重要的,有很多,可以通过使用测序识别那些可能是脆弱的。

我们可以从这个大流行的一件事是,它真的把地图上的分子诊断检测。我认为将分布在许多其他学科和应用程序。

马可Loddo和Gareth Williams说安娜·麦克唐纳科学作家技术网络。188金宝搏备用