在蛋白质组学5个关键挑战,专家告诉

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发表:2019年7月16日

莫莉坎贝尔

蛋白质组学的发展出现的一系列采访专家在蛋白质组学领域的研究。现场目睹了近年来主要的进步,欠发展的高度复杂的技术平台等质谱(MS)和生物信息学工具。

当然,当一个科学领域移动如此之快在这样短的时间内,它遇到挑战,必须克服阻止该领域达成“站住”。我们问的每一个专家,在他们看来,最大的挑战是目前存在于蛋白质组学,和我们如何克服它们?他们发现了这里有五个关键的挑战:

1。推动高通量和商业化

”的趋势之一是发生在人们试图想出更有效和高通量的方法。资助机构的投诉之一就是你可以很快成千上万的基因组序列,但你不能做相同的蛋白质组学。有一个推来增加蛋白质组学的物料通过量,这样我们更兼容基因组学。在我看来真正的令人兴奋的一件事是,此举单个细胞的蛋白质组学。人民终于取得了进展的细胞生物学相关的,不只是那些挤满了一些蛋白如红细胞。这将是一个伟大的地方。

的一件事,我们依赖于女士领域仪器制造商继续推进技术。女士的一些非常基本的基础研究发生在学术界,但是为了使技术有用它必须商业化,商业化带来先进的质量控制和标准的仪器。总是令人兴奋的,当你去asm看看仪器或技术将引入的制造商。”

——约翰·耶茨教授

2。掌握一个技术要求苛刻的领域

“很长一段时间,MS-based蛋白质组学分析技术上要求各级,包括样品处理、分离科学、MS和光谱对序列的分析,丰富和modification-states多肽和蛋白质和错误发现率(罗斯福)考虑。我认为我们在或接近令人兴奋的状态,这些挑战都相当不错,如果不是完全解决。当我们到达那里的时候,我们将能够更强烈地关注创建有趣的新生物或临床研究问题和实验设计,和应对高度引人入胜的问题上面所讨论的,我们最好从可用的数据生成新的生物知识。就我个人而言,我相信,我们会在这方面最成功如果我们生成高质量,高跨大量复制和可再生的数据看来,此时蛋白质组学本质上是实现这一目标。”

——教授Ruedi Aebersold

3所示。找到一个“登月”项目

“字段本身还没有确认或抓住到一个特定的“登月”项目。例如,不会有相当于人类基因组计划,蛋白质组学领域就没有。“人类蛋白质组”是不断波动的信息存档。每个细胞类型都有自己的独特的蛋白质组——这取决于细胞的功能是什么,它取决于时间点你测量细胞的蛋白质含量。人类基因组计划等项目吸引了大量的公关和金钱投资对于基因组学,所以这是一个耻辱,蛋白质组学将没有一个等价的“登月”项目。”

-伊曼纽尔Petricoin教授