一体化测试SARS-CoV-2检测和监测

一种新型COVID-19测试策略可以帮助简化识别过程的情况下,跟踪和检测co-infecting病毒变体。

目前,单独分析和复杂的工作流是参与这三个诊断程序,分析通常表现在高度专业化的设施。KAUST研究人员现在所有三种测试合成为一个过程,应该允许即时跟踪SARS-CoV-2 COVID-19和许多新兴的变体。

”一体化的测试提供了一个有前途的集成解决方案快速实地部署的大流行性病毒检测和突变监测,“干细胞生物学家李莫说,他领导了这一研究。

测试包括便携式briefcase-sized mini-laboratory,避免所有的缓慢而昂贵的技术标准COVID-19筛查和监测。最近的新测试利用遗传方法(称为重组酶聚合酶放大)和新一代便携式音序器快速检测病毒序列的存在,并提供家里的——在96患者样本。

李娜的团队,合作研究人员从沙特阿拉伯、美国和西班牙,设计了测试的SARS-CoV-2基因组解码五段,每个选择跟踪帮助指导变体。他们还包含三种常见呼吸道病毒的分析,会导致症状类似于COVID-19。

与临床工作的合作者从医院在麦加、麦地那和吉达,团队验证技术——称为涅槃——使用鼻子和咽喉拭子从人疑似SARS-CoV-2感染。他们还测试了废水从城市污水收集的样本在KAUST展示的方法可以让全民监督SARS-CoV-2和其他病毒。

“涅槃可以快速高通量的方式诊断多种病毒感染,”笔记冲尾段Bi,在李的实验室博士生。更重要的是,当谈到SARS-CoV-2监控,“它可以同时检测病毒和报告突变,”他补充道。

在快速的支持下研究反应小组(大学智能健康倡议的一部分),李和他的实验室的研究小组正在继续完善涅槃大规模部署的平台。

测试的限制之一是,它只能检测SARS-CoV-2突变在选定的基因组区域,随着新变异的问题继续出现在世界各地,这些地区可能需要更新,以反映病毒的演变特性。

“同时,”李说,“我们正在寻求在诊所与医院合作测试涅槃。”

参考:Bi C, Ramos-Mandujano G,田Y, et al。同时检测和突变SARS-CoV-2监测和快速实地部署排序多个呼吸道病毒的交叉感染。地中海。2021:S2666634021001173。doi: 10.1016 / j.medj.2021.03.015

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