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个体肿瘤包含一个未知的遗传变异的范围

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前列腺癌组织学幻灯片展示。右边是一种正常的格里森价值3(5)中度分化癌。左边是减少正常组织的格里森价值4(5)高度未分化。信贷:Otis Brawley /国家癌症研究所

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理解癌症细胞产生哪些领域可以改善我们了解肿瘤的生长和发展,包括如何改变了基因,随着时间的推移。这一点已经成为可能使用一个名为空间转录组的新技术,科学家可以看到基因变化发生在不破坏组织他们看着。添加一个新的维度,研究人员现在用于揭示细胞突变,生态系统内的一个器官。


当前的技术研究细胞在肿瘤的基因涉及从癌变区域样本和分析这些细胞的DNA。问题是许多癌症,如前列腺癌、三维,这意味着任何一个样本只会给一个小肿瘤的快照。


在一项新的研究发表在自然由英国癌症研究中心,研究人员使用空间转录组创建一个整个前列腺的横断面图,包括健康和癌细胞。通过分组细胞根据相似的遗传身份,他们惊讶地发现,所谓的健康组织领域,已经有许多的癌症的遗传特征。这一发现令人惊讶,因为两种内的遗传变异组织以及大量的细胞被认为是健康的,但通常包含突变与癌细胞。


阿拉斯泰尔的羔羊牛津大学纳菲尔德外科学系,共同领导了这项研究,说:“前列腺组织是三维的,像大多数器官可以开发癌症我们还有很多要学习的细胞变化引起癌症和它开始的地方。我们相当自信的一件事是,它始于基因突变。


“我们从来没有这种级别的决议之前,这个新方法揭示了一些令人吃惊的结果。例如,我们发现许多我们以前认为的拷贝数事件有关专门癌症实际上已经出现在良性的组织。这对诊断具有重要意义,也可能决定哪些部分的癌症需要治疗。”


教授乔阿欣Lundeberg k皇家理工学院,说:“成千上万的组织区域映射在一个实验是前所未有的方法deconvolute肿瘤的异质性及其微环境。这种高分辨率的观点影响我们的寻址方式复杂的生态系统,比如癌症。识别早期事件的可能性是特别令人兴奋的未来。”


此外,研究人员分析了150000多地区三个前列腺,两个乳腺癌,一些皮肤、淋巴结和脑组织,并开发了一个算法跟踪组细胞具有类似克隆基因变化——在他们的精确位置。这种方法使他们从可见组织通过显微镜放大对多细胞结构和正确的基因本身,同时保持组织的整体景观。


参考:埃里克森,他M,巴瑞E, et al。空间解决克隆拷贝数改变良性和恶性组织。自然。2022,608 (7922):360 - 367。doi:10.1038 / s41586 - 022 - 05023 - 2

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