一种用于癌症诊断的新型无细胞DNA提取系统

在人血浆中循环的cfDNA成为癌症诊断中肿瘤突变检测的重要来源。在这项研究中，我们比较了一种基于柱的方法和一种新型的基于自动磁珠的试剂盒(圣淘沙岛SX cfDNA试剂盒(4x8))。此套件经过优化，可用于机器人液体处理平台(圣淘沙岛SX101)。采用ALU重复序列qPCR法和ngs - s法对两种方法提取的cfDNA质量进行评价圣淘沙岛SQ CRC测试。从血浆样本中提取DNA, DNA片段为HCT116 gDNA (~170bp)。喀斯特G13D阳性)使用两种方法。ALU247/115的比例为DNA提取圣淘沙岛试剂盒为0.19 ~ 0.28，柱状法>为0.7 (cfDNA <0.5, gDNA ~1.0)。两种方法提取的DNA数量和质量均足以制备所有样品的NGS文库。喀斯特G13D检测方法提取的样品均为G13D圣淘沙岛试剂盒，但不在柱状提取样品中。的圣淘沙岛cfDNA试剂盒可选择性地从高分子量gDNA上提取cfDNA，是一种从血浆中提取cfDNA的有效方法。集成到基于qPCR和ngs的工作流程使圣淘沙岛cfDNA试剂盒是一种通用的诊断工具，可与各种IVD分析结合使用。