脂质使用电荷远程自动特征碎片离子峰的特征脂肪酸从MALDI MS / MS数据碎片
介绍
谱质谱已被直接用于检测磷脂酰胆碱组织分析(1 - 4)。最近,甘油三酯和磷脂酰胆碱在复杂混合物已确定使用MALDI MS / MS(5、6),负责远程碎片(CRF)以及其他,B、C - G和J离子最近描述的决定因素(7,8,9)。CRF离子促进本地化脂肪酸链的双键和分支。然而,MALDI MS / MS数据分析的主要挑战是在这个过程中产生的大量数据。上述信号的注释需要耗时的手工光谱解释。我们开发了一个软件工具的描述脂质MS / MS数据简化这种类型的数据分析。
方法
商业标准和脂肪从脂肪像橄榄油使用MALDI MS和MS / MS进行分析。样本的准备与DHB矩阵在正离子模式下。MS / MS数据获得使用1 keV碰撞能量和空气作为碰撞气体(5 x10-6托)。SimLipid®数据库创建了包含36299脂质和1305386 structure-specific in-silico负责远程碎片(CRF)离子以及其他特征离子(7,8,9)。SimLipid创建为每个候选的列表结构脂质MS / MS谱基于前体m / z值和其他信息。对于每个候选人,in-silico碎片离子匹配实验MS / MS数据。评分机制是为了区分等压的候选人。
初步结果/文摘
甘油三酯(标记)都检测到单电荷sodiated分子物种。标签的MS / MS数据受到批分析SimLipid®软件。所有的结构都是确定正确的程序。MS / MS谱分析获得标签577.4492 m / z(30:0脂肪酸链分布相同长度的3脂肪酸),结果在5个不同的候选结构的正确结构轴承常见的名字“1、2、3-tricaprinoyl-glycerol”作为脂质得分最高,其次为四个不同的对应于31:0脂肪酸链甘油二酯与2脂肪酸不同长度的分布。CRF离子分离的质量差14 Da表示CH2集团的损失,这是一个分裂的结果中的碳碳键脂肪酸链。CRF离子显示12 da的损失表示双键和C = C键的乳沟。对于这些数据,由于类似的脂肪酸的存在以及集团负责人候选人结构密切相关,CRF离子单独不能辨别正确的结构。程序区分基于标签的特征离子。核实prgram的结果,我们应用技术在分析来自不同来源的脂质如像橄榄油品牌,人造黄油和黄油。
谱质谱已被直接用于检测磷脂酰胆碱组织分析(1 - 4)。最近,甘油三酯和磷脂酰胆碱在复杂混合物已确定使用MALDI MS / MS(5、6),负责远程碎片(CRF)以及其他,B、C - G和J离子最近描述的决定因素(7,8,9)。CRF离子促进本地化脂肪酸链的双键和分支。然而,MALDI MS / MS数据分析的主要挑战是在这个过程中产生的大量数据。上述信号的注释需要耗时的手工光谱解释。我们开发了一个软件工具的描述脂质MS / MS数据简化这种类型的数据分析。
方法
商业标准和脂肪从脂肪像橄榄油使用MALDI MS和MS / MS进行分析。样本的准备与DHB矩阵在正离子模式下。MS / MS数据获得使用1 keV碰撞能量和空气作为碰撞气体(5 x10-6托)。SimLipid®数据库创建了包含36299脂质和1305386 structure-specific in-silico负责远程碎片(CRF)离子以及其他特征离子(7,8,9)。SimLipid创建为每个候选的列表结构脂质MS / MS谱基于前体m / z值和其他信息。对于每个候选人,in-silico碎片离子匹配实验MS / MS数据。评分机制是为了区分等压的候选人。
初步结果/文摘
甘油三酯(标记)都检测到单电荷sodiated分子物种。标签的MS / MS数据受到批分析SimLipid®软件。所有的结构都是确定正确的程序。MS / MS谱分析获得标签577.4492 m / z(30:0脂肪酸链分布相同长度的3脂肪酸),结果在5个不同的候选结构的正确结构轴承常见的名字“1、2、3-tricaprinoyl-glycerol”作为脂质得分最高,其次为四个不同的对应于31:0脂肪酸链甘油二酯与2脂肪酸不同长度的分布。CRF离子分离的质量差14 Da表示CH2集团的损失,这是一个分裂的结果中的碳碳键脂肪酸链。CRF离子显示12 da的损失表示双键和C = C键的乳沟。对于这些数据,由于类似的脂肪酸的存在以及集团负责人候选人结构密切相关,CRF离子单独不能辨别正确的结构。程序区分基于标签的特征离子。核实prgram的结果,我们应用技术在分析来自不同来源的脂质如像橄榄油品牌,人造黄油和黄油。
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