为异构用户群构建和部署数字病理基础设施

当今数字病理硬件和软件解决方案的灵活性允许机构创建定制的解决方案，以满足个人用户的需求。我们建立了一个集中的基础设施，集成了各种成像平台(亮场、荧光、多供应商格式)。结果:在这种多样化的硬件基础上，编写了一个由商业软件和开源软件包组成的混合解决方案。为了有效地挖掘这些数据，采用自顶向下的方法对各个平台进行管理和集成。自定义编码用于在需要时与各种供应商软件和服务器应用程序交互。数字病理学所涉及的远不止获取一个切片扫描仪。在VUB，我们在一个架构上使用了五个不同的成像平台。我们现在将所有模式的数据存储在一个存储设备中，并可以通过一个访问点进行管理。最终的结果是一个由异构可伸缩信息筒仓组成的互联网络。我们目前有三个WSI的主要用例:教育、生物银行和心灵病理学。 We have about 7 terabytes of data online, and serve 50 users across different research groups and departments.