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Fluidigm推出全球首个可重复使用的生物芯片架构


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Fluidigm公司宣布开发了世界上第一个可重复使用的商业市场生物芯片架构。据制造商介绍,这些可重复使用的集成流体电路(IFCs)将降低SNP基因分型成本,旨在支持加速样本吞吐量,同时保持99.75%或更高精度的数据质量和99%或更高的呼叫率。

Fluidigm最初发明这种架构是为了支持由美国农业部(USDA)的主要科学研究机构农业研究局(ARS)推动的一个渐进的新项目。

该项目的目标是将高样本通量基因分型降低到每数据点一美分,这将使基因分析广泛应用于蔬菜和水果种子、牲畜(牛、猪、羊、家禽等)和渔业管理。预计这将改善食品供应的质量和数量,同时降低生产成本。

“我们知道,在农业中明智地使用遗传学可以显著提高我们预测动物或种子抵御疾病的能力、生产高质量产品和提高生产生活的能力。目前的挑战是,基因分型的成本太高,无法进行大量的实验来找到重要的遗传标记。然后,一旦发现,在构成我们粮食生产系统的数百万种子、动物和鱼类中实施这些遗传质量控制的成本仍然太高,”Curt Van Tassell博士解释说。, ARS研究遗传学家。

“我们认为,适度的成本降低不足以改变传统的选择做法,而传统的选择做法将极大地改善我们的食品供应。我们决定设定一个“登月”类型的目标。为了达到转变工业和科学家所必需的临界点,我们需要将每个数据点的成本降低到一美分——全部包括(化学试剂、消耗品等),”Van Tassell补充道。

“如果我们能实现这种成本结构,我们就能以每只动物不到一美元的价格确定亲子关系和可追溯性信息。这个低价格点将允许在以前不可行的条件下进行动物评估,例如在撒哈拉以南非洲。这项技术可以为世界上一些最贫穷的牲畜生产者提供改善动物的信息。通过开发和使用特定品种或特性的面板,我们可以在牛以及其他牲畜和植物物种的生产力上实现大幅提高,”Van Tassell说。

Fluidigm的新重用架构代表了实现这一崇高目标的第一步。

Fluidigm总裁兼首席执行官Gajus Worthington表示:“我们很高兴Fluidigm的可重复使用生物芯片可以为改善食品供应做出贡献,并为全球的AgBio科学家和生产商带来基因分析和测试的好处。”

“一年前,当我们开始开发可重复使用的芯片时,这个概念是有争议的。但我们认为这个想法很有吸引力,我们的客户也是如此。我很高兴我们的科学家和工程师没有被传统思维所束缚,认为微流体设备的可重用性是不可能的。他们没有默认常规,而是克服了过去的教条,创造了一个工程奇迹。我相信,对于我们的行业和我们所服务的生命科学领域来说,可重用性将是革命性的。可重用性降低了成本,消除了浪费,并赋予了灵活性。我想不出有什么发明比Fluidigm更让我兴奋了。”Worthington补充道。

Worthington表示,该公司最近还推出了一款超高速热循环器——FC1™循环器,并正在添加一款新的IFC控制器,旨在支持可重复使用的芯片。最初,复用系列产品将包括芯片、一个新的控制器、FC1 Cycler和EP1™Reader或BioMark™系统。一种新的芯片和仪器将很快发布,让高样本通量基因分型客户走上可重复使用的道路。

沃辛顿说:“我们期望在今年和明年将更多的芯片配置、仪器和分析推向市场,这将为更多的客户提供可重复使用的产品,继续降低每数据点的成本,并为基因分析制定路线,为世界提供更好的食品供应做出贡献。”

Fluidigm的重复使用技术的应用也将有助于提高生命科学产业的竞争力。

“我们最近将Fluidigm系统添加到我们为客户提供的基因组服务家族中。我们看到,植物和动物研究人员对高质量、高成本效益的基因检测服务的需求越来越大。我们在这方面做了一些工作,但成本一直是一个障碍。Fluidigm的新型可重复使用芯片将使我们的农业客户能够以显著降低的成本实现SNP基因分型的巨大好处,”Expression Analysis总裁兼首席执行官Steve McPhail说。

由Van Tassell博士领导的ARS项目计划将可重复使用的芯片集成到他们的项目中,以识别分子标记,以确定如何提高牛的评估性状的预测准确性(Van Tassell的研究重点),从而提高生产力的改进速度。ARS项目涉及政府、学术界和工业界的顶尖研究人员,以寻找最佳和最具成本效益的基因检测标记和方法,以提高国家农业资源的质量和生产力。

农业研究局(ARS)是美国农业部的主要科学研究机构。它的工作是为每天影响美国人的农业问题寻找解决方案,从农田到餐桌。
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