PacBio变换对表观基因组和简化工作流的访问

PacBio,高质量的主要开发人员,高度精确测序解决方案,今天宣布变革能力的释放检测DNA甲基化使用续集国际教育协会和续集II系统。这个扩展PacBio独特的和高度能够HiFi现在包括访问表观基因组测序技术,第二层常常让未知的基因信息由于常见的测序技术的基本限制。PacBio单分子的方法提供了一个更全面的观点在测序的分子的行为。微妙的模式在这个丰富的信息允许修改基地在天然DNA检测标准HiFi测序。因此,科学家们获得额外成本为零的表观基因组,努力,或复杂性。这一进展会解锁新的重要机遇跨广泛的应用基础和应用生物科学。

这个更新还包括一个广泛的工作流程改进,提高客户体验,如简化、统一,并加速图书馆准备工作流和耗材,住仪器性能监控,和在仪器分析支持重组腺相关病毒(rAAV)基因组测序,快速增长的生物制药应用程序相关的基因疗法和疫苗开发研究。

“与每个产品发布我们继续改善的效用和价值续集二世和国际教育协会平台,为研究人员提供独特的功能区分PacBio HiFi测序和所有其他的测序技术,“基督教亨利说,PacBio的总裁兼首席执行官。“我们的最新续集II增强以及国际教育协会平台,包括底测序和改进工作流将简化生成高质量数据的能力和使深入理解基因组的复杂性。”

“多个测试目前需要评估罕见疾病例测序和甲基化变异。HiFi测序有可能变化,通过测量在全基因组遗传和表观遗传变异在一个单一的实验。我们已经成功使用底儿童慈爱堪萨斯城HiFi测序识别异常甲基化在重复扩张的情况下,我们计划把它应用到所有未来的基因组序列。访问另一个方面是令人兴奋的基因组,而不需要改变样品处理或测序过程,”艾米丽法罗博士说,公司治理文化,实验室操作主管儿童慈爱堪萨斯城和儿科副教授密苏里州堪萨斯城大学医学院。

“我们发现CpG甲基化模式在西红柿和玉米基因组中发现使用HiFi测序是高度整合到标准重亚硫酸盐测序但是带来力量解决转座的元素和其他序列较短的读取。当结合的不可思议的能力HiFi测序基因组大会和差异分析,这将创建一个无与伦比的机会ultra-high-quality基因组和表观基因组分析的植物和脊椎动物的基因组从单一数据类型,”迈克尔·沙茨博士说,彭博特聘教授约翰霍普金斯大学计算机科学和生物学。

PacBio HiFi测序技术提供了一个全面的视图的基因组和转录组。但是DNA包含更多信息巧妙地编码为“后生”对DNA碱基的修改。这表观基因组的影响基因表达和扮演着重要的角色在决定生物功能在健康和疾病。历史上,访问表观基因组已经在阅读困难和需要牺牲长度、准确性和完整性,增加工作流程的复杂性。包括自动检测的重要修改基地在人类和其他物种(CpG图案5 mc) PacBio测序技术提供联合基因组和表观基因组不牺牲读取长度,准确性,完整性,不需要额外的工作流步骤。

PacBio简化工作流是一个重点,这个最新更新更易于执行HiFi测序。公司的新SMRTbell准备工具包3.0能够减少工作流时间全基因组测序应用50%或更多,减少所需的DNA输入40%(每人类基因组3微克)。SMRTbell准备工具包3.0适用于广泛的应用和支持自动化和批处理的样品。PacBio还引入了一个新的single-reaction测序板和SMRT细胞8 m托盘,使客户更好地运行样品在他们方便的时候。