IBM eX5改进了桑格研究所的下一代测序
生命科学和高性能计算(HPC)有一种共生关系——生命科学
今天的研究在很大程度上依赖于HPC基础设施,即使HPC本身正在迅速发展以满足
更新,更苛刻的数据分析需求,如下一代领域
测序(门店)。
本文概述了NGS,然后介绍了与生命科学研究相关的关键技术和计算问题,具体参考了Sanger研究所,这些问题通过IBM基于英特尔的eX5系统解决。基于来自IBM和Sanger Institute的真实科学实验数据,我们强调IBM eX5服务器是如何扩展的,并且最适合于计算和内存密集型应用程序,如Velvet、ABySS和SOAP。生命科学应用不仅受益于eX5企业系统专为Velvet应用而设计的灵活性、密集计算能力、512GB-1TB内存,还受益于卓越的I/O、内存性能和高速互连,以及IBM在简化集群管理方面的敏锐,无与伦比的电力和能源效率的工程创新。
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