高通量大规模Spectrometry-Based筛查试验的趋势
介绍
质谱(MS)是一种数据丰富,label-free自由与广泛的适用性分析格式,表型分析。通过监测变化的分子离子的质量收取比它使底物的直接测量产品转换反应。这是没有任何标签或特定试验试剂技术的参与,如果吞吐量将是一个极具吸引力的通用低成本筛查技术。不幸的是传统的女士通常涉及液相色谱(LC)一步删除非易失性盐和缓冲组件,可以抑制离子形成。这限制了吞吐量每样1 - 15分钟,这严重限制了传统的应用系统,女士和排除了大多数screening-related活动。
当前最先进的关于高吞吐量女士由相对较少的选择。其中最著名的是安捷伦速射的365年是一个女士完全集成系统,提供自动化的高容量的样本分析。它使用一个喷射女士和涉及在线样本准备。它提供周期倍8秒/样本或略低于1小时/ 384板处理。替代方法包括获得额外的吞吐量和能力通过操作多个质系统并行;网上多路复用到4平行LC系统一个女士(如热科学超越系统);和利用策略如基质多路复用和/或复合池,使更多目标或化合物的同时检测。其他方法女士声称更高的吞吐量包括LAESI-MS成像,扁样品直接从微型板块井或幻灯片之前用最少的样本准备分析(例如山龙眼la dp - 1000系统)和基于地表MALDI-MS涉及声学样本沉积的复杂生物混合物排列芯片衬底事先样本准备(例如NextVal MassInsight)。最后新兴技术样品的直接加载到女士系统(如声调剂使用Labcyte回声)可能提供最大的承诺使高吞吐量,低成本,label-free分析。
2014年11月HTStec进行一个市场调查高吞吐量MS-based筛选化验主要在制药公司的研究实验室中,生物技术和学术界。这项调查是由HTStec的跟踪新兴生命科学市场。目标是全面文档当前方法的实现和使用HT MS-based筛查检测,和了解未来用户需求/偏好。本文包含从HTStec市场选择的结果的报告,2014高通量大规模Spec-Based筛查分析趋势。它的目的是为读者提供一个简短的了解最近的市场趋势。它涵盖了只有10的30原始问题详细完整的报告。完整的发表的报告应该咨询查看整个数据集,分解反应的每一个细节问题,其分割和对未来的估计。请点击这里为更多的信息。
为什么使用MS-based筛选化验:
最具说服力的理由想要使用MS-based筛选化验报告如图1所示。同时能够量化多个分析物在单样本排名最令人信服的原因使用MS-based筛选化验。这是紧随其后的是直接端点的定量,避免使用耦合分析;真正label-free检测技术;然后避免分子标签、荧光染料、记者、抗体等。排名最引人注目的服从内生端点量化从本地单个细胞。
图1所示。最有说服力的理由想要使用MS-Based筛选化验
受访者大多数想使用MS-based筛选化验分析:
受访者的材料主要是由MS-based筛选化验分析感兴趣提出了如图2所示。这表明基质/代谢物/反应产品排名最高(最有可能的分析)。这是紧随其后的是小分子;肽;蛋白质;然后碎片。
图2。受访者最希望分析使用MS-Based筛选化验
目标类MS-based筛选方法有应用程序:
目标类,被调查者最感兴趣的应用MS-based报告筛选方法,如图3所示。这表明激酶是目标类那里有最大的兴趣应用MS-based筛查方法。其次是ADME-Tox & PK;表观遗传的目标,然后其他的酶。有兴趣是为其他胞质受体。
图3。目标类受访者最感兴趣的应用MS-Based筛查方法
生物样品类型分析了MS-based筛选方法:
生物样品的类型被MS-based筛查分析方法给出了图4所示。可溶性整除取自均匀化验被评为最有可能的生物样本调查。其次是来自细胞溶解产物化验;生物液体从体内研究收集;然后完整的单个细胞或细胞层。有兴趣在2 d组织部分和完整的3 d细胞microtissues。
图4。类型的最感兴趣的生物样品分析MS-Based筛查方法
ADME MS-based筛查的应用:
的ADME应用MS-based筛选受访者最感兴趣的是呈现在图5中。这表明代谢稳定性被评为ADME领域最大的利益。其次是临床试验样本,然后血浆蛋白结合和溶解度。兴趣是Pgp抑制。
主要MS-based筛查的局限性:
潜在问题的程度与MS-based筛选化验限制提出了图6。这显示仪表成本高排名的主要限制与MS-based今天检查化验。其次是缺乏真正完全自动化的高吞吐量的系统;需要一个有经验的操作人员;然后需要样品分析前准备。至少限制小型筛选样本体积太大。
图6。程度与MS-Based筛选化验限制相关的潜在问题
反馈所隐含的高吞吐量MS-based化验:
调查发现,平均至少每24小时一天10 k-25k样品加工构成真正的高通量筛选(高温超导)制药受访者。他们也想要一个中等MS-based分析吞吐量的5倍,可实现的安捷伦速射的RF365今天(即5 * 384片/小时)。受访者意见可用MS-technology的未来应用和部署平台,兼容1536板和低体积样品利用率(< 5 ul)都是不错的选择,会影响将来的采购。实现更高的吞吐量MS-based初级筛选绝大多数的受访者也准备考虑复合池(药物混合物)和多路复用策略(如多路复用不同的目标在同一试验;多路复用同一个目标使用不同的肽底物在同一试验;或多路复用多个LC系统一个MS)。
高在MS-based筛选化验预计将最常用的:
受访者计划(或让)多数使用高吞吐量MS-based筛选化验报告在图7中。这表明,高吞吐量MS-based筛选化验预计将在未来取得最大的影响以初级筛选(高温超导)(2016)。其次是分析/中等/正交/计数器筛选;然后行动研究模式和ADMET & PK化验。
图7。受访者计划(或让)大多数使用HT MS-Based筛选化验吗
最喜欢的真正的高通量自动化MS-based筛查方法,分析:
的方法使真正意义上的高通量自动化MS-based筛选化验报告预计将在未来获得最吸引在图8所示。这表明,喷射女士,通常涉及在线样本准备(例如安捷伦速射的)选择(43%)是最首选的方法。其次是声波直接分发到女士(如使用Labcyte回声)和基质多路复用和/或复合池结合喷射女士,通常涉及在线样本准备选择(17%)。至少牵引预计地基MALDI-MS涉及声学样本沉积的复杂生物混合物排列芯片衬底事先样本准备(例如NextVal MassInsight)。
图8。方法来支持真正的HT自动化MS-Based筛选化验将获得未来最有吸引力
女士的首选供应商检测系统:
女士的首选供应商检测系统的受访者将寻求投资如果新的高通量方法MS-based筛选化验图9中给出。女士的首选供应商检测系统Sciex (28%);安捷伦科技公司(21%);热科学(20%);和水(14%)。所有其他供应商有不到10%的份额。
图9。首选供应商购买新女士检测系统。请注意这个厂商偏好不应被视为一个真正的市场份额。它是基于调查应答者的首选供应商如果购买一个新的女士检测系统,而不是美元总额实际销售。
受访者意见MS-based筛选化验的状态:
协议的受访者的水平与一些关于MS-based筛选化验的状态呈现在图10所示。协议的声明是最积极的(最大的协议),使真正的高吞吐量MS-based高温超导将产生深远影响;最大和最负(分歧)与“MS-based化验永远不会首选筛查格式我们所有的化验的。至少有争议的声明(即被调查者既不同意也不反对此观点)是“MS-based化验更便宜比其他分析格式来实现的。
图10。水平的协议,陈述MS-Based筛选化验的状态
结论:
上面的选择结果报告显示,同时能够量化多个分析物在一个示例是最令人信服的理由想要访问MS-based筛选化验。女士是一个真正的label-free技术方法排名紧随其后。关于MS-based筛选化验受访者主要希望能够分析基质/代谢物/反应产物。活期利息是不足为奇的是集中在应用MS-based筛查方法酶激酶和目标表观遗传与可溶性蛋白质整除取自均匀(主要是生化)大多数调查化验。虽然可能扩展这些研究从细胞溶解产物化验是极大的期望。兴趣也很高ADME应用领域与代谢稳定分析女士目前最有吸引力的分析视角。女士仪器的重要成本,其次是缺乏真正完全自动化高通量女士系统仍然是最大因素限制的采用MS-based今天检查化验。尽管一些更高的吞吐量女士系统可用,这些系统的吞吐量可实现的最好的(如安捷伦速射的RF365系统)目前至少5倍,需要大大影响初级筛查(高温超导),使大型图书馆。尽管缺乏所需的吞吐量当前调查应答者的首选的方法来实现高吞吐量仍然是目前商用即喷射女士,通常涉及在线样本准备(例如安捷伦速射的)。下一个方法将在未来获得最吸引的新兴概念声直接分发到女士(例如使用Labcyte呼应)。
未来的高吞吐量MS-based筛选化验后正处于一个转折点在sla会议在华盛顿表示,华盛顿在2015年2月由阿斯利康科学家Labcyte和水域已经成功地利用声学液滴喷射电喷射女士像一个标准的注入。这样发展下去有可能预示着女士现有的方法依赖于液相色谱分离。集成声液滴喷射和女士可能会导致系统的约每小时4000数据点到一个高灵敏度label-free探测器。正在调查若干仪器配置和优化高吞吐量的产品还没有市场,但能力负荷样本1536盘成一个质谱检测器,没有信用证样本准备,在一个较高的利率从最小检测量(低至几µLs)可能显著影响药物发现,也影响其他生命科学领域的研究。
受调查者的观点在一些语句对未来状态MS-based筛选化验因此高度适当的环境。高水平的协议声明的支持真正的高吞吐量MS-based高温超导将产生深远影响的和强烈的分歧声明“MS-based化验永远不会首选筛查格式为所有我们的化验都是符合未来高吞吐量MS-based仪表真正适合需求的筛查实验室非常普遍。
作者:约翰•Comley HTStec有限公司董事总经理
免责声明:HTStec有限行使由于保健编译和准备报告的这些选择的结果,是基于信息被提交的个人公司。HTStec有限没有核实这些信息的准确性,也没有被建立的权威HTStec有限的披露信息。HTStec有限明确放弃任何保证有关这些选定的发现包括任何保证适销性或健身为特定目的,并保证性能,和可能出现的任何保证的交易或商业惯例。不保修的要么是表达或暗示对使用这些选择的结果。在任何情况下应HTStec有限为偶然性、特殊的、间接、直接或间接损害或损失的利润,业务中断,或相关费用从使用这些选择可能出现的结果,包括但不限于数据的不准确造成的。
