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(实验室)一步可再生的科学

一块(实验室)一步可再生的科学内容的形象
Masaka野外台实验室。和LSHTM乌干达的信贷:MRC /进行的研究单位

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科学的再现性危机有多坏?统计数据表明动力不足的研究,可怜的分享已发表的文献和关注当然在绝大多数接受调查的科学家建议的相当糟糕。

治愈这个懒惰,笨拙,罕见的场合,欺诈的研究长期以来似乎躺在数字解决方案,为厂商的电子实验室笔记本(eln)定期证明。总部位于伦敦的Labstep牛津大学的创业,认为他们的工具地址民族解放军的失败。声称现在已经给出一些具体的证据,宣布的研究队伍本单位在LSHTM冈比亚将试验Labstep在他们Banjul-based设施。

“如果你花费8点到10点在实验室里,非常密集的东西。你想要做的最后一件事是花几个小时打字的日记你所做的事。“Labstep首席执行官兼联合创始人杰克。斯科菲尔德已经巧妙地表达问题与传统民族解放军,他和联合创始人Jan Domanski Labstep寻求正确的。这些问题背后公司的起源,这是在他还是牛津大学博士生。大学的支持导致轮投资,最终以£500000笔从欧洲主要种子基金科技产业在2017年代中期。Labstep只是去年9月全面启动,斯科菲尔德说,但现在用于全球600所大学。

此外,它是免费的学者。

基金这一慷慨的方式协助学术界,Labstep想目标生物技术公司和商业实体,但进入冈比亚,斯科菲尔德说,是第一个机构Labstep的审判。

一个更好的数字化方法

那么什么是古典民族解放军Labstep和它如何改进。

设计Labstep,斯科菲尔德说,他和Domanski问自己,“我们可以把一个非常不同的方法,我们捕捉实时处理数据的协议,你执行,你如何倾斜——自动应用程序编程接口(API)与设备在你的实验室,这样你可以上传一切吗?”

Labstep超过600大学的平台使用。

这意味着在日常实验室工作是一旦研究员上传了他们的协议变成Labstep,斯科菲尔德说,“可以共享在你实验室组——如果有人做出任何改变,任何新的调整,这将自动创建一个新版本,所以这是完全版本控制。像GitHub,可以有分支机构。日子一去不复返了,你花10周后一定协议在一张纸上,有人会转身说,“我们已经更新这个,你已经浪费了你的时间。你可以按照一步一步在实验室板凳。”

这个顺序的追踪协议,Labstep创建一个即时跟踪审计跟踪允许所有更改。平台是为移动设备优化,这意味着如果你离开实验室,一切都会同步到桌面的记录已经到位。

再现性的好处显而易见科学之外,斯科菲尔德说:“每件事都有一个时间戳说这个用户做了这个动作。没有删除。所以一切都是存档或创建新版本时,您不能编辑。太好了,而不只是再现性的角度来看,它对研究人员的诊断能力。如果你回头,你经常挠你的头说,“好吧,为什么不工作?”,经常搞不清楚,你能够搜索和看到,因为所有的资源(协议)中使用标记实际上这个样品或具体的批号,我曾经在这条线的实验意味着这些结果变成这样。”

基层的方法

600 -图斯科菲尔德大学最初报价我让Labstep听起来像一个科技巨头,但事实上只有少数使用的工具往往是在任何一个机构的研究。迄今为止,规模较小的设置是什么意思是Labstep可以培养一种密切的关系和他们的用户,帮助技术主要是通过建议和口碑传播。草根系统最终导致了新的MRC审判,斯科菲尔德说。

本单位在LSHTM冈比亚

信贷:在LSHTM MRC冈比亚

本单位在冈比亚去年庆祝了自己的70年华诞,并发表163篇同行评议论文。总计超过1200员工,其中320实验室工作人员,机构工作在几个领域,创新在新生儿医学、病理学和免疫学。
从各个服务人员和实验室组织机构带来的挑战和机遇,斯科菲尔德说。“我们刚开始的时候,我们只是做了个人然后随着规模,要求π(首席研究员)与这些博士生和博士后与下面的人在实验室组和什么层次的控制和访问权限和用户权限和管理需要实现的功能,这是当你开始有多个实验室组再次放大。但好处是也放大了。因此,实际上,你可以拥有这些协作和共享组织跨组织的人们可以分享内容。这是令人难以置信的强大。”

移动方法带路

在非洲研究仍然是一个新兴领域——非洲大陆目前贡献而已世界上1%的研究——这也是禁食增长地区的科学生产,斯科菲尔德发现,提出了一种不同的技术景观Labstep的优势。“他们的移动互联网方式比在英国,每个人都只是通过他们的手机使用互联网。所以这实际上让我们绕过这“一切都运行通过WiFi”状态。因为我们优化的移动,我的意思是,人们可以很容易地使用平板电脑的长椅上,然后自动同步回桌面。”

切换到手机的方法似乎是要求得到最像Labstep这样的工具。斯科菲尔德表示,该公司的英国高级用户往往有一个专用的平板电脑在他们的实验室里,这是一个即时的好处人员在特定的领域:“实际上,我们抓了很多牵引与人工作在高度污染的地区,在那里他们可以不采取任何或通风柜。所以很高兴能够把平板电脑里面了。任何人都可以登录,他们可以运行实验,可以捕获所有数据并没有船纸。”

中断繁殖

斯科菲尔德希望在冈比亚Labstep的审判会有一个机构的好处,但是他的最终目标是使整个科学界受益。“有机会我们有一个真正的积极影响科学界,有一个真正的积极影响个体研究人员的日常生活。这是我们要实现的。我们一组科学家正在试图解决这个真正的问题每个人都知道,这个问题在科学和可重用性。”一个激动人心的创新是Labstep协议可以链接到发表论文,这意味着读者可以立即下载尝试繁殖的协议的审计记录。虽然这项技术还年轻,斯科菲尔德希望在几年的时间,将会有一系列Labstep-powered出版物。现在,一些组织已经上传协议到这个平台上。

斯科菲尔德是科学解决再现性危机的能力持乐观态度,看到Labstep战斗作为一个有用的工具:“我们有一个伟大的团队,我们有伟大的牵引,我们筹集了很多钱,和有一个真正的独特的机会来构建一个工具,是非常具有破坏性的民族解放军的空间。这样会允许更可再生的、更加开放的科学,它希望当天可以产生巨大影响的个人和社区的输出”。

满足作者
Ruairi J麦肯齐
Ruairi J麦肯齐
高级科学作家
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