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NGS市场概览- OGT访谈


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牛津基因技术公司(OGT)最近发表了一项研究人员使用下一代测序(NGS)的调查结果。我借此机会与OGT的传播总监Stephen Archibald博士进行了交谈,以更好地了解OGT和NGS市场。

LC:你能多给我们介绍一下OGT吗?

油气痕迹:牛津基因技术(OGT)由Ed Southern教授创立,为医学研究人员提供改进的产品和服务,以准确检测和分析人类疾病。我们的Genefficiency™基因组服务,提供一系列高品质的下一代测序和微阵列服务。此外,我们的创新系列CytoSure™产品为细胞遗传学研究提供完整的阵列解决方案。我们的服务和产品配有一流的分析软件,使研究人员可以轻松地快速识别有意义的结果。

LC:最近NGS调查的主要发现是什么?

油气痕迹:这项调查揭示了许多有趣的发现。例如,生物信息学被认为是NGS使用的最大障碍(56%),因此36%的受访者将这一过程的关键阶段外包。随着测序能力的提高和试剂成本的降低,内部生物信息学资源的压力比以往任何时候都更加明显。作为一家基因组服务提供商,我们不仅提供高质量的数据,还提供一份完整的注释交互式报告,使研究人员能够在没有内部生物信息学资源的情况下快速确定有意义的结果,这一发现非常符合我们的产品。然而,根据调查数据,显然仍有许多面临数据分析挑战的研究人员尚未体验到外包的好处。

LC:有没有什么意想不到的发现?

油气痕迹:我们惊喜地发现,与全基因组测序(13%)相比,46%的研究人员更喜欢靶向重测序方法(全外显子组和靶向面板测序)。研究人员清楚地认识到定向重测序的好处,包括成本效益和覆盖深度的增加,这提高了发现生物学相关变异的机会。

LC:OGT打算如何使用这份报告中的数据?

油气痕迹:OGT定期进行市场调查,以确保我们为客户提供最合适的技术和应用,以满足他们的研究目标。此外,通过确定研究人员面临的挑战,我们可以开发有助于确保知情决策的客户信息。这一调查直接导致了我们最近的创作关于选择正确的NGS方法的白皮书同时我们报告软件的演示版本,向客户展示了无需依赖内部生物信息学资源就能轻松识别有意义的结果。此外,我们使用这些调查的数据来推动我们的网络研讨会计划,确保内容符合研究人员的需求。我们的下一次网络研讨会定于10月举行,将直接解决针对NGS面板定制诱饵设计的挑战。

LC:您认为NGS最受欢迎的研究领域是什么?你预计会有什么变化吗?

油气痕迹:NGS的前3个研究领域是癌症(27%)、罕见病(17%)和发育障碍(15%)。这些应用领域非常适合使用靶向测序,特别是靶向面板测序,由于其成本效益和敏感性,是开发临床重点分析的首选工具。随着目标板的使用增加,我们期望看到更多的重点放在诱饵设计优化上。这是OGT等服务提供商可以帮助研究人员确保提供敏感和可重复的结果的另一个领域。例如,我们的SureSeq™实体肿瘤面板与领先的癌症研究人员一起设计,通过我们独特的探针设计算法,提供了异常均匀的覆盖范围。基于本次调查提供的结果,我们将推出新的靶向测序面板,涵盖更多的研究领域,并再次强调我们的定制面板设计和测序服务如何使研究人员受益。

路易丝·康林,技术网络编辑188金宝搏备用
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