实验室信息学;攀爬的斜率启蒙?
在最近的2013年欧洲实验室自动化2013 (ELA)会议在汉堡,德国技术网络的信息编辑海伦Gillespie医师,坐下来和约翰特里格PhaseFour信息学主任讨论集成实验室。组织的演讲会议期间覆盖e-Laboratory的概念,或集成实验室。他说,e-Laboratory变得日益密切,特别是电子实验室笔记本取代纸同行。然而,许多挑战仍然存在,为了充分利用数字技术存在的潜在的协助和扩展科学知识的课程。本文解决了这些问题以及电子实验室笔记本后会发生什么(ELN)实现
TN:在ELA 2013表示你指出,是有区别的实验室自动化和实验室信息。你能解释为TN的读者有什么区别吗?
组织:没有硬性的规则,有时有一定的模糊性条款的方式使用实验室自动化和实验室信息。我喜欢区分基础上,实验室自动化是指利用技术来简化或替代手工操作的设备和流程,而实验室信息学通常指的是应用程序的IT系统实验室数据和信息的处理以及实验室操作的优化。换句话说,实验室自动化主要处理设备的实时控制和数据的采集和处理,而实验室信息学重点实验室的持续的管理数据和信息——通常由多用户系统,如LIMS,长效磺胺和民族解放军。
TN:增加的复杂性科学影响收敛的趋势?
组织:不同学科之间的界限已经越来越模糊了许多年。这是特别明显的生命科学行业,越来越多在其他领域。当我们调查越挖越深,在发展中了解我们的现有的和未来的产品,流程和服务,每个学科都有一席之地。需要采取一个整体的、多学科视图不仅目的和功能的产品,过程,或者服务,但也影响健康、安全和环境。在实验室里,生成一个需求在我们的自动化和信息工具集成和使用的所有学科为了关联产品生命周期相关的所有数据。它还需要工具提供查询的方法,分析和可视化数据来帮助开发更好的科学理解和更好的决策。在专门规程的筒仓不再可行了。
TN:大多数实验室创建一个全面的功能需求规范(FRS)之前,选择一个民族解放军。但已经作出了选择和实施后会发生什么?什么影响形成他们民族解放军实现实验室能期待什么?
组织:我想在三个具体方面的功能需求规范ELN选择过程;第一个是底层业务需求——是什么高水平的目标,这是我们要解决的问题,是一个民族解放军怎么解决它?通常包括在这个层次成本(我们准备付多少钱来解决问题和ROI ?);我们需要考虑什么因素在合规方面,法律和公司治理?;,将它所约束。第二层次的需求涉及到定义特定操作的功能,将使我们能够满足业务需要;即。,将使我们的系统功能来解决这个问题。第三个方面是用户需求,主要是解决易用性和实用性,换句话说,“系统”应该如何工作,以确保用户验收。虽然是正常的,包括用户需求中的功能需求,让他们有一个好处逻辑上分开,以确保“易于使用”和“有用性”标准是由用户来判断,而不是由项目团队。 Getting the FRS right is the primary focus in the selection process, but then the implementation strategy becomes the critical factor. Rolling out an ELN will to some extent, impact the way people work. It will represent a cultural and operational change in the laboratory that may not be universally welcomed. Nevertheless, the outcomes–assuming a successful deployment–will almost certainly bring productivity benefits, primarily through the elimination of unproductive, paper-manipulation processes, but also through better opportunities for sharing data and information.
TN:什么样的好处大部分实验室接受由于民族解放军实现?这些是真正意识到或有高故障点吗?
组织:让我们先处理失败。人总是难以承认失败,并在主几乎不可能有任何灾难性的失败民族解放军部署。然而,总有风险,可能出错,但在实践中,大多数出现的问题,往往是变更管理问题。让用户验收是一个关键成功因素对于几乎每一个民族解放军项目,这样,“人”的问题是通常在部署过程中得到了很多的关注。在利益的方面,大多数民族解放军部署声称该地区生产力of10% - 20%。然而,这一点儿也不告诉科学的质量。通常有大量的轶事证据关于时间储蓄,仅仅通过简单的访问ELN数据库中积累信息。与同事能够搜索数据库和连接/同事是世界上相当容易纸笔记本。集中系统的笔记本也很容易提取管理报告。这意味着许多简单的度量标准实验室性能可以访问,如数量的实验,实验时间,时间见证并签字,等。因此,吞吐量成为关键指标,重点强调实验室的工作效率。 But as lab automation and lab informatics take us closer to an asymptotic limit in terms of productivity, we should be looking to the tools to enable us to deliver better science. It is quite common to find ‘soft’ objectives associated with an ELN requirements specification, such as ‘improving knowledge management (KM)’. Unfortunately it is a challenge to get any quantification in terms of KM performance; as far as KM is concerned, technology is a big part of the problem, but a small part of the solution.
TN:集成问题——实验室面临的最大障碍是什么当整合民族解放军与其他实验室的电子基础设施?
组织:对很多实验室,引入一个民族解放军代表一个重要的一步成为一台或无纸化实验室。“无纸化”这个词有点误导,因为大多数实验室的真正目的是成为一个完全集成的环境中部署现代工具和技术来提高实验室效率提供无缝集成的系统和搜索存储库数据的完整性、真实性和可靠性。实现这一目标的主要障碍可以归因于两个方面;首先文化,其次技术。文化问题在很大程度上是一个变化的管理;拿走一个科学家的实验室笔记本并代之以一个电子工具并不总是受欢迎的举动,尽管对业务明显的好处。一直有一种强烈的个人所有权与传统纸质笔记本,而一个民族解放军提倡一种开放和共享是有益的标准。让用户通过改变过程永远是第一个障碍被克服。在技术方面,有两个因素需要考虑。首先,技术继续发展的增长速度要比我们的企业可以很容易地适应。消费者技术往往是更先进的比我们使用的技术在我们的实验室中,往往有一定的原因的。 The constraints placed on laboratories by business requirements and regulatory compliance will always drive the need for proven, stable and robust technologies; we cannot afford to take risks. However, our personal experiences of consumer technologies, particularly in the sphere of communications, sharing and collaboration are often far in advance of what we experience in the lab, and this can cause some frustration with the functional limitations within the lab’s IT infrastructure. The second area is that of connectivity. The opportunity that ELNs, LIMS or SDMSserve as the ‘informatics hub’ in a fully integrated environment is somewhat challenged by the lack of laboratory data interchange and communication standards. This issue has been debated for years, and continues to be debated without any universal progress being made. It’s a complex issue, and one line of thought is that despite the various initiatives undertaken over the years to resolve the issue, it’s probably too late to find a universal solution. The industry is dependent on third party integrators, custom code or single-vendor solutions to address the needs. This is in sharp contrast to the trend we see in consumer technologies, and there is much we can learn, particularly from the way social tools address communication and collaboration that would facilitate better integration of laboratory tools in support of knowledge management objectives.
TN:在ELA 2013表示你指出,是有区别的实验室自动化和实验室信息。你能解释为TN的读者有什么区别吗?
组织:没有硬性的规则,有时有一定的模糊性条款的方式使用实验室自动化和实验室信息。我喜欢区分基础上,实验室自动化是指利用技术来简化或替代手工操作的设备和流程,而实验室信息学通常指的是应用程序的IT系统实验室数据和信息的处理以及实验室操作的优化。换句话说,实验室自动化主要处理设备的实时控制和数据的采集和处理,而实验室信息学重点实验室的持续的管理数据和信息——通常由多用户系统,如LIMS,长效磺胺和民族解放军。
TN:增加的复杂性科学影响收敛的趋势?
组织:不同学科之间的界限已经越来越模糊了许多年。这是特别明显的生命科学行业,越来越多在其他领域。当我们调查越挖越深,在发展中了解我们的现有的和未来的产品,流程和服务,每个学科都有一席之地。需要采取一个整体的、多学科视图不仅目的和功能的产品,过程,或者服务,但也影响健康、安全和环境。在实验室里,生成一个需求在我们的自动化和信息工具集成和使用的所有学科为了关联产品生命周期相关的所有数据。它还需要工具提供查询的方法,分析和可视化数据来帮助开发更好的科学理解和更好的决策。在专门规程的筒仓不再可行了。
TN:大多数实验室创建一个全面的功能需求规范(FRS)之前,选择一个民族解放军。但已经作出了选择和实施后会发生什么?什么影响形成他们民族解放军实现实验室能期待什么?
组织:我想在三个具体方面的功能需求规范ELN选择过程;第一个是底层业务需求——是什么高水平的目标,这是我们要解决的问题,是一个民族解放军怎么解决它?通常包括在这个层次成本(我们准备付多少钱来解决问题和ROI ?);我们需要考虑什么因素在合规方面,法律和公司治理?;,将它所约束。第二层次的需求涉及到定义特定操作的功能,将使我们能够满足业务需要;即。,将使我们的系统功能来解决这个问题。第三个方面是用户需求,主要是解决易用性和实用性,换句话说,“系统”应该如何工作,以确保用户验收。虽然是正常的,包括用户需求中的功能需求,让他们有一个好处逻辑上分开,以确保“易于使用”和“有用性”标准是由用户来判断,而不是由项目团队。 Getting the FRS right is the primary focus in the selection process, but then the implementation strategy becomes the critical factor. Rolling out an ELN will to some extent, impact the way people work. It will represent a cultural and operational change in the laboratory that may not be universally welcomed. Nevertheless, the outcomes–assuming a successful deployment–will almost certainly bring productivity benefits, primarily through the elimination of unproductive, paper-manipulation processes, but also through better opportunities for sharing data and information.
TN:什么样的好处大部分实验室接受由于民族解放军实现?这些是真正意识到或有高故障点吗?
组织:让我们先处理失败。人总是难以承认失败,并在主几乎不可能有任何灾难性的失败民族解放军部署。然而,总有风险,可能出错,但在实践中,大多数出现的问题,往往是变更管理问题。让用户验收是一个关键成功因素对于几乎每一个民族解放军项目,这样,“人”的问题是通常在部署过程中得到了很多的关注。在利益的方面,大多数民族解放军部署声称该地区生产力of10% - 20%。然而,这一点儿也不告诉科学的质量。通常有大量的轶事证据关于时间储蓄,仅仅通过简单的访问ELN数据库中积累信息。与同事能够搜索数据库和连接/同事是世界上相当容易纸笔记本。集中系统的笔记本也很容易提取管理报告。这意味着许多简单的度量标准实验室性能可以访问,如数量的实验,实验时间,时间见证并签字,等。因此,吞吐量成为关键指标,重点强调实验室的工作效率。 But as lab automation and lab informatics take us closer to an asymptotic limit in terms of productivity, we should be looking to the tools to enable us to deliver better science. It is quite common to find ‘soft’ objectives associated with an ELN requirements specification, such as ‘improving knowledge management (KM)’. Unfortunately it is a challenge to get any quantification in terms of KM performance; as far as KM is concerned, technology is a big part of the problem, but a small part of the solution.
TN:集成问题——实验室面临的最大障碍是什么当整合民族解放军与其他实验室的电子基础设施?
组织:对很多实验室,引入一个民族解放军代表一个重要的一步成为一台或无纸化实验室。“无纸化”这个词有点误导,因为大多数实验室的真正目的是成为一个完全集成的环境中部署现代工具和技术来提高实验室效率提供无缝集成的系统和搜索存储库数据的完整性、真实性和可靠性。实现这一目标的主要障碍可以归因于两个方面;首先文化,其次技术。文化问题在很大程度上是一个变化的管理;拿走一个科学家的实验室笔记本并代之以一个电子工具并不总是受欢迎的举动,尽管对业务明显的好处。一直有一种强烈的个人所有权与传统纸质笔记本,而一个民族解放军提倡一种开放和共享是有益的标准。让用户通过改变过程永远是第一个障碍被克服。在技术方面,有两个因素需要考虑。首先,技术继续发展的增长速度要比我们的企业可以很容易地适应。消费者技术往往是更先进的比我们使用的技术在我们的实验室中,往往有一定的原因的。 The constraints placed on laboratories by business requirements and regulatory compliance will always drive the need for proven, stable and robust technologies; we cannot afford to take risks. However, our personal experiences of consumer technologies, particularly in the sphere of communications, sharing and collaboration are often far in advance of what we experience in the lab, and this can cause some frustration with the functional limitations within the lab’s IT infrastructure. The second area is that of connectivity. The opportunity that ELNs, LIMS or SDMSserve as the ‘informatics hub’ in a fully integrated environment is somewhat challenged by the lack of laboratory data interchange and communication standards. This issue has been debated for years, and continues to be debated without any universal progress being made. It’s a complex issue, and one line of thought is that despite the various initiatives undertaken over the years to resolve the issue, it’s probably too late to find a universal solution. The industry is dependent on third party integrators, custom code or single-vendor solutions to address the needs. This is in sharp contrast to the trend we see in consumer technologies, and there is much we can learn, particularly from the way social tools address communication and collaboration that would facilitate better integration of laboratory tools in support of knowledge management objectives.
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