蛋白质组学帮助对抗COVID-19
研究蛋白质组可以对细胞、组织或生物的生理状态提供前所未有的深入了解。SomaLogic公司的SomaScan®Assay可在少量生物材料中同时测量约5000种蛋白质。如此大规模的蛋白质分析为传染病的研究提供了潜力COVID-19由SARS-CoV-2病毒引起.
188金宝搏备用SomaLogic首席医疗官Stephen Williams采访了蛋白质组学,了解蛋白质组学如何有助于对抗COVID-19,以及在这个关键时刻SomaScan检测的可用性。
莫莉·坎贝尔(主持人):对于我们不熟悉的读者,请您告诉我们SomaScan®化验?
斯蒂芬·威廉姆斯(SW):SomaScan检测方法可以在一小份血液样本中同时测量大约5000种人类蛋白质的水平,其浓度范围很广。不像基因在人的一生中基本保持不变,人体内的蛋白质会随着病原体、饮食、慢性疾病和药物等内外因素的变化而不断变化。大规模扫描蛋白质可以提供有关当前健康状况和近期疾病风险的信息。
MC:如何利用这项技术来了解SARS-CoV-2感染如何影响人体?
西南:蛋白质就像身体的互联网——它们在器官和生物系统之间传递信息。人类宿主对任何感染的反应涉及先天免疫系统和适应性免疫系统中的蛋白质;下游炎症会上调细胞因子等蛋白质,受损的细胞和器官会将蛋白质泄漏到血液中。正因为如此,一次扫描数千种基于血液的蛋白质可以揭示哪个系统在自然史的哪个阶段占主导地位(这些信息可以帮助药物靶标)。
此外,除了感染本身,蛋白质还与潜在的健康状况有关,这些健康状况已被证明会影响感染的后果——如果潜在的“健康储备”很差,那么即使是中度严重的感染也可能会压倒它。
这导致了蛋白质组学的几个不同用例:
- 了解宿主对感染反应的自然历史可以使现有药物与疾病的正确阶段相匹配
- 了解哪些蛋白质与感染的严重程度有关
- 在感染症状出现的早期预测谁将病情严重,谁将能够回家,从而能够及早治疗,并将有限的资源集中在最需要治疗的人身上
- 在未感染人群中预测哪些人会因感染而产生严重后果(结合潜在健康评估和先天免疫)——这些人应该首先接种疫苗,并保持最大的社交距离
MC:你能告诉我们更多关于SomaScan®检测在这个关键时刻的可用性吗?
西南:我们向COVID-19/SARS-CoV-2研究人员和药物开发人员免费提供SomaScan检测.我们的目标是检测每个合格的临床样本,并尽可能快速和广泛地共享结果数据。我们有一个专门用于COVID-19研究的实验室,并可根据需要扩大这一能力。
MC: SomaLogic是否能够扩展目前利用该技术抗击COVID-19的任何研究项目?
西南:一般来说:
- 有一些项目在疾病的轻度/中度/重度阶段采集血液样本,其中一些在同一参与者中进行纵向研究
- 有关于未受感染的卫生工作者(其中一些人将被感染)的项目
- 在大型生物库中有一些项目,因为其他原因已经在大量人群中收集了样本,其中一些人将被感染
Soma Logic首席营销官Stephen Williams接受了科技网络科学作家Molly Campbell的采访。188金宝搏备用