酵母三辆混合动力依赖于功能的结合转录因子(TF)紧随其后的表达报告基因在转基因酵母细胞。在药物靶蛋白相互作用,DNA结合域(DBD) TF是接近其激活域(广告)。这个激活的转录HIS3报告基因,使酵母细胞缺乏组氨酸的选择性培养基上生长。阳性克隆的DNA测序,揭示了合作伙伴交互。
YChemH技术是一个三分量的系统
- 一个钩子DBD蛋白质融合
- 靶蛋白库碎片融合转录的广告
- 一个小分子标记的配体结合的蛋白质
我们的技术
小分子的发现bioactives或first-in-class药物通常始于识别可能的治疗目标(s)的功能。我们的酵母三辆混合动力系统(Y3H)技术可以支持你的早期药物发现项目:
我们的技术
我们的最终YChemH™是一个修改版的Y2H系统,使直接蛋白质的识别目标(或非标靶)的生物活性分子。在YChemH方法中,带标记的探针分子的兴趣被用作诱饵为蛋白质的目标从一个屏幕我们的135 + domain-enriched高复杂cDNA库准备从任何细胞,组织或器官。
由于我们的完整的解决方案,您将能够优化你的药物发现项目的成功率。
我们的解决方案
酵母三辆混合动力依赖于功能的结合转录因子(TF)紧随其后的表达报告基因在转基因酵母细胞。在药物靶蛋白相互作用,DNA结合域(DBD) TF是接近其激活域(广告)。这个激活的转录HIS3报告基因,使酵母细胞缺乏组氨酸的选择性培养基上生长。阳性克隆的DNA测序,揭示了合作伙伴交互。
YChemH技术是一个三分量的系统
我们提供大量的cDNA和基因组库(135 +),以适应您的目标识别筛选项目。乡镇图书馆是由组织、细胞系、主细胞或整个生物来自各种物种包括人类、啮齿动物、植物、细菌、等使用专利细胞间交配试验,库进行筛选以饱和、平均库覆盖的8倍。
新库构造的要求。
你最终的结果YChemH屏幕总结了三个互补的用户友好的可交付成果:
以下在酵母验证实验YChemH屏幕后可以执行:
我们的解决方案
最终YChemH原则
酵母三辆混合动力依赖于功能的结合转录因子(TF)紧随其后的表达报告基因在转基因酵母细胞。在药物靶蛋白相互作用,DNA结合域(DBD) TF是接近其激活域(广告)。这个激活的转录HIS3报告基因,使酵母细胞缺乏组氨酸的选择性培养基上生长。阳性克隆的DNA测序,揭示了合作伙伴交互。
YChemH技术是一个三分量的系统
我们的最终库
我们提供大量的cDNA和基因组库(135 +),以适应您的目标识别筛选项目。乡镇图书馆是由组织、细胞系、主细胞或整个生物来自各种物种包括人类、啮齿动物、植物、细菌、等使用专利细胞间交配试验,库进行筛选以饱和、平均库覆盖的8倍。
新库构造的要求。
最终YChemH关键好处
可交付成果
你最终的结果YChemH屏幕总结了三个互补的用户友好的可交付成果:
交互验证
以下在酵母验证实验YChemH屏幕后可以执行:
我们的出版物
通过平移监管MNK2缺乏强化β-cell再生
克里斯托Karampelias,凯瑟琳·瓦特,夏洛特·l·马特,天使费尔南德斯鲁伊兹,Habib Rezanejad, Jiarui Mi,小菁,《联合楚,杰森·w·Locasale,格雷戈里·s . Korbutt Meritxell·罗维拉,Ola拉尔森&玻Andersson自然化学生物学2022年6月
PAPD5/7宿主因素是乙型肝炎病毒RNA稳定所必需的。
穆勒H,洛佩兹,Tropberger P, Wildum年代,Schmaler J,皮德森L,汉族人X, Y, Ottosen年代,杨年代,年轻JAT Javanbakht H .肝脏病学。2019年4月,69 (4):1398 - 1411。doi: 10.1002 / hep.30329。Epub 2019 3月1。PMID: 30365161。
抗糖尿病的药物是搜罗:识别刺激β细胞再生的新途径
Karampelias C。论文,卡罗林斯卡医学院,2021年。
化学Dimerizers三辆混合动力系统为小型Molecule-Target蛋白质分析
De Clercq DJ, Tavernier J,列文年代,Van Calenbergh S ACS化学杂志。2016年8月19日,11 (8):2075 - 90。doi: 10.1021 / acschembio.5b00811。Epub 2016 6月20。PMID: 27267544。
常见问题解答
你怎么支持我的项目寻找目标的蛋白质(s)我的药吗?
根据保密协议,我们一起讨论如果你的项目准备对目标识别研究。
无论技术,你知道的越多你的化合物(s)和生物学,更有效的目标反褶积。
如果结构活性关系的假设(SAR)尚未公布或不够强,我们可以帮助你开车药物化学的努力。
建议使用互补的方法。Y3H系统是一个简单的目标ID方法等不需要特定的设备质量规范。我们的综合生物信息学将简化的分析结果。
有出版物Y3H系统吗?
Y3H和YchemH出版物:
你的技术识别非目标吗?
是的,YChemH技术可以识别功能目标和非目标根据标记小分子化合物。我们的动物任意和无偏YChemH方法致力于评估你的polypharmacology分子。我们可以确定意想不到的目标指导你在铅优化或临床选择候选人。
药物发现和开发是一个高风险和昂贵的过程。晚期失败的候选人都强调药物的重要性,理解他们的行动方式。一种药物可以有多个目标,会以不同的方式影响不同的生物过程包括副作用。“很快失败、早期失败”,消除由于非标靶和毒性的风险。
你也可以发现药物重新定位的机会。
YchemH屏幕需要什么样的标签?
我们YChemH筛选平台可以容纳不同的标签系统:DHFR与TMP或MTX配体,Halo-tag或Snap-tag技术。我们已经优化了大肠杆菌的筛选条件DHFR和TMP对最好的信号/噪声比。(大肠杆菌DHFR Ki 0.17海里(Cammarata M, et al .化学科学。2017))。
标签战略与TMP YChemH配体类似于关联下拉+女士使用生物素配体。你可以自己进行标记或要求我们为你照顾它。
Y3H目标ID的好方法吗?
是的,这是一个简单的和技术简单的方法。你将受益于最全面Y2H技术,我们的高度复杂的图书馆和一个快速的周转时间。假阳性率是减少由于依赖关系分析和分数我们每个交互的信心。
请查收附加的出版物的更多信息:
我们可以签署一份保密协议之前讨论我的项目吗?
是的,我们可以为您提供我们共同的保密协议(CDA)模板。我们也可以与您的CDA模板。
的知识产权(IP)的结果吗?
是的,你自己的结果的IP。我们的药物靶标识别平台可以在收取费用。
我的实验室曾使用Hybrigenics服务来执行酵母2台混合动力屏幕。他们的数据在我们的研究提供了一个新的方向。他们还使用了Y2H筛选选择. .
我们问Hybrigenics选择intrabodies对四个不同的蛋白质参与贩卖水泡。他们很快就为我们提供了几个候选人/蛋白质、即食的形式. .
我的团队一直使用Hybrigenics提供的服务执行Y2H屏幕从拟南芥的图书馆使用病毒蛋白质作为鱼饵在几个场合,和非常满意。
我的实验室曾使用Hybrigenics服务来执行酵母2台混合动力屏幕。他们的数据在我们的研究提供了一个新的方向。他们还使用了Y2H筛选选择nanobodies做intrabodies对我们感兴趣的蛋白质。Hybrigenics团队把一个大努力为我们提供几个候选克隆。所有的克隆都提供作为哺乳动物表达质粒和经历了最初的验证。更深入的验证后,我们现在有试剂,在几个不同的化验工作。我印象深刻的客户服务和奉献在Hybrigenics科研小组。
我们问Hybrigenics选择intrabodies对四个不同的蛋白质参与贩卖水泡。他们很快就为我们提供了几个候选人/蛋白质、即食的形式为哺乳动物表达质粒。我们已经验证这些intrabodies。红色荧光蛋白融合,他们将会非常有价值的工具来阻止我们的目标蛋白质在活细胞中。
我的团队一直使用Hybrigenics提供的服务执行Y2H屏幕从拟南芥的图书馆使用病毒蛋白质作为鱼饵在几个场合,和非常满意。
不仅Hybrigenics诱饵设计团队有一个伟大的经验,在执行高覆盖率的屏幕,最重要的是在得分和精确定位技术获得的候选人假阳性,这是无价的资产,但我也发现与他们合作非常愉快。
他们是友好,支持,和高主管,我总是一起欣赏我们的讨论。
我将肯定不会再执行一个酵母二者混合屏幕自己和我强烈推荐他们的高质量的服务,真的值这个价。
此外,屏幕非常成功的酵母二者混合后使用我们的一个病毒蛋白作为诱饵,我们组也有机会利用他们新开发Hybribody服务,即合成单一nanobodies链。Hybrigenics选定几个VHH intrabodies,进一步验证了在哺乳动物细胞中使用荧光显微镜。我们实验室现在目前验证它们在植物细胞中,我们获得的初步数据显得非常有前途。除了作为基本研究工具来检测我们的蛋白质在活细胞,同时获得的intrabodies有用抑制病毒增殖过程中的关键步骤,从而可能引发新的抗病毒药物设计策略。