7日晶体结构预测计算化学家盲目测试带来了新的挑战

宣布的挑战

本周第七届CSP盲测开始,计算化学的重大挑战。它将世界领先的方法在晶体结构预测考验真正的目标——高酒吧由以前的工作。7测试系统在工业和学术界主要来自实验的预测。

CSP盲测计划如何运作来帮助开发计算技术来预测晶体结构。这一领域具有潜在的革命性药物和农药的设计和开发方法。

CSP的重要性

晶体的三维结构和包装材料的性质有很大的影响——这是最相关的药物发现和开发。

小分子药物在水晶、固体形式。这种形式经历了广泛的测试,以确保它是稳定的,有效的,和安全。然而,它是可能的一个小分子有多个晶体形式-多晶型物分子结构是一样的,但是包装是不同的。这种现象被广泛观察——例如可可脂6多晶型物,导致不同的融化温度影响巧克力的质地。

预测当另一种变形形式是不简单。上下文中的药物,其影响可以是巨大的——不同的多晶型物不稳定在存储、无效或最坏的不安全。例如艾滋病毒/艾滋病的抗逆转录病毒药物,必须从市场在1998年第二次变形突然出现不溶性,因此不那么有效(鲍尔et al,制药,2001)。

预测的能力在网上如果另一个变形是可能的,可能会允许制药公司识别此类风险。

CSP已经是一个关键的一部分,大多数制药公司的科学发现和开发过程,但仍在发展中,与CSP盲目测试等活动扮演了关键角色。

CSP盲目测试是如何工作的呢?

中国疾控中心管理和运行CSP盲目测试自1999年第一次迭代。团队选择一组解决了但未发表的论文结构作为测试目标。二维结构提供给参与者,有大约1年预测三维结构和结晶性质使用最好的方法。一旦在预测,解决结构显示和比较两个允许进一步细化方法和经验。

来自学术界和工业界的领先科学家进入测试,看看他们的新方法执行。的每个测试公布的结果在文献中,看到每一次伟大的飞跃的进步。

“CSP盲目测试是一个很好的例子,如何先进科学方法通过仔细和有组织的计划。”

——安东尼·尼科尔斯OpenEye科学软件的总裁兼首席执行官。

“CSP盲目测试是一个很好的例子,如何先进科学方法通过仔细和有组织的计划。”的总裁兼首席执行官安东尼•尼科尔斯说OpenEye科学软件。“盲检测的原理是科学方法的核心,和中国疾控中心作为主持人允许CSP方法在一个现实的考验的方式帮助他们进步和改进。”

CSP是如何与其他盲目挑战?

盲目测试评估软件的方法有一个漫长而辉煌的历史。随着历史CSP的挑战,各种团体举行了其它盲目挑战如蛋白质折叠、对接挑战和属性预测的挑战。

蛋白质折叠上升通过计算化学领域进入科普聚光灯,与谷歌等科技公司DeepMind进入CASP挑战,和游戏像FoldIt提高意识更广泛。但CSP提供了一个更大的挑战;有更多的化学多样性,大量可能的结构经常被评估和没有一个正确的结果。此外,CSP是一个有用的方法生成的结构模型需要比蛋白质更好的规模预测是正确的。

“可靠并且易于计算,CSP将彻底改变药物和农药发展方面,将会导致新的有机材料设计方法在其他领域。”

——高级研究员CCDC杰森·科尔。

“可靠并且易于计算,CSP将彻底改变药物和农药发展方面,将会导致新的有机材料设计方法在其他领域。”杰森·科尔,CCDC高级研究员解释道。“能够准确预测晶体材料的性质之前合成药品安全的巨大影响,材料的稳定性和更多。但各种因素影响小分子结构,包装和稳定使这个难题解决——盲人测试旨在支持在这一重要领域进一步发展。”

找到更多关于CSP盲目测试,见以前的结果,适用于参与中国疾控中心网站上。