外遗传性分析可能导致许多疾病的新治疗药物靶点

使用新的分析工具,加州大学圣地亚哥医学院的研究人员和伊坎在西奈山医学院的解码类风湿性关节炎(RA)的表观遗传景观,一种常见的自身免疫性疾病,影响超过130万美国人。揭幕RA的表观基因组蛋白质和DNA分子的装修和帮助打开和关闭基因——科学家们揭示了一个惊人的发现:一个重叠的原因RA和亨廷顿氏舞蹈症,致命的大脑和无法治愈的遗传疾病。

研究结果发表在5月15日的问题自然通讯。

研究小组,由资深作者加里Firestein,医学博士,院长和副副校长在加州大学圣地亚哥分校医学院转化医学说,意想不到的联系RA和亨廷顿氏舞蹈症开辟了新的治疗靶点和药物的可能性条件。

“我们不希望找到一个重叠类风湿性关节炎和亨廷顿氏舞蹈症,但发现意想不到的原因,我们开发了这项技术。现在我们发现了这种联系,我们希望打开一扇门为疾病,患者治疗选择”Firestein说。

类风湿性关节炎是一种慢性炎症性疾病,导致关节疼痛和肿胀。作为一种自身免疫性疾病,它还可以影响到其他器官,包括心脏和血管。治疗RA已有所改善,但10到20%的病人不响应任何可用的药物。

使用的调查方法研究小组参与开发一种新颖的算法,计算规则,或一组叫做EpiSig,集成和表观遗传的基因组合的数量降低风湿性关节炎患者。团队可以识别新细胞信号通路。

“比较不同类型的外遗传性数据是很困难的,因为它涉及到各种不同的数据子集,通常不能一起分析,包括各种方法的DNA被修改,”王伟(音译)说,博士,教授,化学,生物化学和细胞和分子医学在加州大学圣地亚哥分校医学院的。

“这种方法也可以用来找到其他疾病之间的联系,不仅是类风湿性关节炎,“Firestein补充道。“基因被发现,研究人员可以确定新的治疗方案,甚至重新现有药物。”

Firestein和团队研究了表观基因组在细胞类风湿性关节炎患者的关节。骨关节炎患者,这是一种软骨变性的疾病,作为对照组。这两个数据集通过膨胀过程进行了分析,研究染色质,DNA和组蛋白修饰。结果12 tb的数据(12万亿字节),然后使用EpiSig分析。

基因组表观遗传学,或“上面”,是研究的过程,改变基因结构不改变DNA序列本身。这些DNA的修改是必不可少的对人类成长和发展和改变人们的生活。表观遗传变化受多种环境因素的影响,包括压力、活动和生活方式的选择。

“通过揭示背后的综合表观遗传学风湿性关节炎,我们现在有一个更好的理解这种疾病。更重要的是,我们的新方法,不仅可以帮助患有类风湿性关节炎,而且人与其他免疫介导性疾病,”Firestein说。

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