探索DNA微阵列的逆转录

摘要

我们设计了96个未修饰的50 mer DNA寡核苷酸，每2 kb对应一个已知的最长的人类基因:Titin, nebula和Obscurin，都表达在人类肌肉中(基因长度约100kb)。DNA寡核苷酸靶标为阳性(a- actin)和阴性对照(ß-Actin)，用于人类肌肉组织，并以1 - 50µM浓度在环氧涂层玻片上标记，以创建DNA微阵列。

研究了反转录(RT)的Oligo-dT、随机和非启动策略。结果采用微阵列斑点荧光分析。

我们的结果表明，随机启动是长基因表达分析的最佳方法。这种RT方法可能适用于交替剪接的基因和在3 ' -区域没有唯一探针的基因。