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环形染色体构象捕获(4C)在人前列腺细胞系中RAD51B和RAD23B snp的功能分析

前列腺癌(PrCa)是发达国家男性中最常被诊断出的癌症,也是最具遗传性的实体肿瘤之一,估计有58%的病例是由遗传因素引起的。PSA筛查的有效性仍然存在争议,需要新的分子生物标志物来改善治疗的应用。
研究结果导致了一个常见和罕见变异的混合模型,具有不同的效应大小,以解释PrCa的遗传起源。BRCA2和BRCA1的罕见突变会导致风险中度升高,而全基因组关联研究(GWAS)已经确定了超过100种常见的低外显率PrCa易感性变异,一些接近或在RAD51B和RAD23B DNA修复基因1,2,3内

RAD51B是RAD51蛋白家族成员,在双链DNA断裂的同源重组修复(homologous recombination repair, HRR)通路中起相关作用。其过表达可导致细胞周期延迟和凋亡。基因序列的变异与乳腺癌、卵巢癌、子宫内膜癌、结直肠癌、头颈癌和急性白血病有关。RAD23B参与了核苷酸切除修复(NER)系统,尽管它的作用还不完全清楚,但该基因的多态性与乳腺癌易感性有关。

染色质在拓扑关联结构域(TADs)中高度组织,由100kb至1Mb的局部相互作用DNA区域集群组成。这些结构域的内部动态和相互动态允许涉及启动子、增强子和沉默子等调控元件的不同区域相互作用,从而导致基因表达和重组的调控4
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