向NIST的全面的自下而上和自上而下的分析参考单克隆抗体

仔细描述需要治疗蛋白由于其固有的可变性。参考蛋白质标准可以代表该行业的主要分析工具,但它必须良好,以作为参考。在这项研究中,高分辨率质谱数据的NIST马伯临时参考材料(RM 8670年,很多3 f1b)分析了新的生物信息学工具有效地识别和量化的修改,包括氧化、脱氨基,糖化,糖基化,序列变异。

重和轻链组件是衡量自底向上和自顶向下(有时称为middle-down)方法的高分辨率热费希尔Orbitrap精英质谱仪用人CID, HCD和要领分裂模式。分析的数据的组合搜索引擎Byonic™和新检验软件Byologic®相结合比较MS1和一份数据流执行label-free量化通过提取离子色谱图的比例(XICs)修改修改的肽。此外,新的肽图软件,Byomap™,来量化和注释肽映射。

自底向上分析几个数据集导致广泛的序列变异位点专一的识别和量化,糖化,糖基化,氧化反应和脱酰氨基作用。糖基化(包括自下而上和自上而下的)测量的完整的分子形式。自顶向下分析Byonic片段生成整个序列的注释,提供了要领,至少在最初阶段,提供最大程度的碎片覆盖。氧化网站,糖基化和截断在自上而下的观察分析。总的来说,适度的高质量的质谱,NIST的广泛的定量分析临时参考标准进行快速的方式。