通过理解NGS库的复杂性和偏倚来实现单细胞测序

对基因组学的需求越来越大，以更少的输入量从样本中提供更高质量的测序数据。随着基因组等价物的数量在较低的输入量下减少，文库偏差和文库复杂性对数据质量的影响越来越大。更少的偏见，更复杂的库会导致更均匀和更完整的覆盖，从而提高测序效率并降低成本。本应用说明描述了使用Illumina®平台上的accelel -NGS™2S DNA文库试剂盒用于全基因组测序(WGS)，从人类和微生物基因组DNA生成的下一代测序(NGS)文库的序列覆盖性能和分子复杂性的保存。比较的主要商业可用的方法也提出。从无pcr文库支持的最低输入DNA量(Accel-NGS 2S为100 ng，领先试剂盒为1 μg)来看，这项新技术的文库复杂性提高了50%以上。使用Broad研究所定义的1000个坏启动子(~79% GC)来描述极端富GC区域的覆盖。随后的测序结果表明，这些高gc含量启动子具有优越的覆盖性能，其中accelel - ngs 2S比市场领先的试剂盒更好地覆盖了88%。同样，从富含at和富含gc的细菌基因组制备的文库测序分析显示了良好的覆盖分布。