补充下一代测序技术与安捷伦SureSelect DNA捕获阵列

大规模并行DNA测序技术的关键基因组生物学和医学的重要性,因为他们可以使遗传变异的全面、系统的评价。目前,这些测序技术是面向整个基因组测序。更广泛的采用这些技术需要一个更具成本效益的方法比pcr称作一个更高的吞吐量和更大的通用性方法浓缩等目标,目标排序的感兴趣的多个离散的基因组区域。验证使用安捷伦DNA微阵列为目标浓缩,安捷伦与格雷格Hannon博士的实验室(冷泉港实验室)来捕获其实地区与乳腺癌相关的测序研究。我们有针对性的人类基因组的0.025%,使用60米的安捷伦244 k阵列探测器捕获大约1287个离散的基因组区域。
捕获的DNA然后被释放出来并测序。各种杂交条件进行了测试,最终获得2700倍浓缩在目标区域测序读。系统被认为是有效的,与测序读覆盖超过99.8%的目标区域和目标的98%基地与至少一个读和归一化平均每读27每百万32-base深度阅读。这些结果进行rm,安捷伦DNA微阵列可以提供一个快速和有效的解决方案感兴趣的有针对性的测序的基因组区域。