改善图书馆准备提供更高比例的目标读和更好的覆盖SureSelectXT2目标捕获
下一代测序(上天)为科学界提供了一个强大的工具,在更短的时间内大而复杂的基因组序列比传统Sanger测序方法。尽管如此,我们还没有到达一个点,人类基因组测序和分析32亿年基地时间或成本效益。目标捕获策略已经被证明提供一个解决这个问题通过减少基因组的复杂性相关的问题被问。目标捕获方法需要全基因组库准备随后通过探针杂交系统的目标选择感兴趣的基因组区域大规模并行测序紧随其后。捕获的规模和复杂性是用户的依赖,但大规模的范围可以从目标的所有蛋白质编码区域(~ 50 Mb)的一个子集基因被认为与特定的生物功能(< 10 Mb)。Pre-capture池的多个样本之前目标捕获是一个成本有效的方法获得的数据量最大化为多个样品在一个序列运行。几个目标捕获技术商业化,都有各自的优点和缺点。安捷伦SureSelectXT2系统提供了一个广泛的调查集包括所有外显子许多不同的生物模型的选择,以及灵活的自定义选项允许用户自己设计捕获面板,所有这些都可以购买独立构建sequence-ready捕获所需的上游和下游试剂库。
目标捕获性能依赖于几个变量;然而,一个重要的因素是采用条形码阻断策略。条形码阻塞寡核苷酸结合平台适配器绑定序列,以减少非特异性探针杂交。期间出现问题类的分子在溶液中退火的杂交捕获目标无关的DNA序列在免费终端适配器序列探针杂交。相同的适配器终端侧翼序列中的每个模板分子杂交池。因此,这个分子及其补充在非常高的浓度相对于其他分子在溶液中。non-complementary模板分子的加入在终端适配器序列可以两个分子,或一连串的许多不同的序列无关。因此,诱饵的存在结合位点的分子将拉低整个链接链有关,导致更多的污染分子的数量和增加脱靶读入目标捕获测序结果。
Bioo科学现在提供所有试剂需要上游和下游的探针杂交准备sequence-ready,多路采集库兼容所有SureSelectXT2诱饵集。NEXTflex条形码拦截器技术通过index-specific阻塞寡核苷酸,最大允许绑定效率大大降低日常阅读中遇到的数量大大小小的目标捕获化验。此外,利用NEXTflex试剂与SureSelectXT2诱饵通过强大的图书馆准备工作流程设定改进目标捕获效率以及重要的杂交效率的提高。
