世界上第一个移动遗传学实验室适合你的口袋里

冷泉港实验室(3)科学家开发出世界上第一个移动基因组序列分析仪,一个名为iGenomics的新iPhone应用程序。通过配对iPhone手持DNA定序器,用户可以创建一个移动遗传学实验室,让人想起“分析仪”出现在《星际迷航》。iGenomics应用完全在iOS设备上运行,减少需要笔记本电脑或大型设备,这是有用的流行性和生态学工作者。Aspyn Palatnick编程iGenomics》冷泉港实验室在兼职副教授迈克尔·沙茨的实验室,在一段八年,开始时,他是一个14岁的高中实习。

补充的iPhone应用程序开发微型DNA测序设备由牛津纳米孔。Palatnick,现在一个软件工程师在Facebook,已经经历了在构建iPhone应用程序加入沙茨实验室。他和沙茨意识到:

”为测序继续得到更小的,没有技术可让你研究DNA在移动设备上。大部分的研究背景:调整、分析,完成对大型服务器集群或高端笔记本电脑。”

宝贝认识到科学家研究流行病”飞在行李箱的纳米孔和笔记本电脑和其他服务器,分析远程领域。”iGenomics有助于通过基因组研究更便携,方便和负担得起的。

用户可以空投测序数据,使DNA分析在最偏远地区——甚至那些没有上网。iGenomics甚至可能很快进入的宇航员,宝贝描述:

“有很多感兴趣的在空间做DNA测序。我想看看是否有一种方法我们可以得到iGenomics。有很多人感兴趣。真是证明如何是不可能,你知道,在普通电脑上任何形式的分析。只是不可能让他们和你在一起。”

在《Gigascience,Palatnick和沙茨报告iGenomics算法可以快速地图DNA序列的病毒病原体,如流感病毒或Zika病毒,并确定突变对诊断和治疗很重要。他们也提供一个在线教程其他病毒基因组分析,如从SARS-CoV-2病人。

沙茨的梦想,这个装置能帮助实地工作者和公民科学家一样:

“今天,我们所有的携带专业相机在我们的口袋里,所以不难想象在接下来的几年,我们都带着自己的DNA测序仪在我们的智能手机,。有很多机会去做的测量环境,寻找病原体,甚至做扫描自己的。”

参考:Ghedin周Palatnick A, B, E,沙茨MC. iGenomics:全面的DNA序列分析在你的智能手机。GigaScience。2020;9 (giaa138)。doi:10.1093 / gigascience / giaa138。

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