像其他病毒,严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2 (SARS-CoV-2)可以变异和发展随着时间的推移,B.1.1.7等导致的遗传变异,在英国首次发现2020年12月。在大多数情况下,微小的基因变化”是无关紧要的,“Arvind Kothandaraman PerkinElmer告诉188金宝搏备用。然而,“还有其他的情况下,这些突变可能导致病毒传染病和威胁越来越宿主,”他补充道。
SARS-CoV-2变异不断地监控由世界卫生组织(世卫组织)SARS-CoV-2病毒进化工作组和几个国家当局,使相关突变的快速识别和研究他们的潜在影响在病毒传播能力和疾病严重程度。目前的对策的有效性,如诊断,治疗和疫苗也是评估,以及调查如何减少负面影响。
B.1.1.7变体的研究发现,家族包含多个突变基因编码的蛋白质(S),这可能会影响一些诊断测试的有效性。”69 - 70年英国[B.1.1.7]删除S基因变异导致负面报道结果由于一个完整的辍学的基因区域的目标特定的rt - pcr分析,“Kothandaraman说。
一个rt - pcr测试是什么?
rt - pcr代表逆转录聚合酶链反应。这是一个分子方法广泛用于检测病毒和其他病原体的遗传物质。
“一个rt - pcr测试是COVID-19诊断的金标准,因为这分子检测提供了一种高度可靠的方法来检测SARS-CoV-2的存在在人类的示例中,“Kothandaraman评论。
样品测试得到了通过一个口咽或鼻咽拭子,或唾液。任何SARS-CoV-2遗传物质样本中孤立和反转录的RNA转化为互补的DNA。针对特定核酸序列引物SARS-CoV-2基因组是用来定义区域的DNA会被放大。
1月8日,美国食品和药物管理局(FDA)发布了海啸预警临床实验室工作人员和卫生保健提供者突出”,假阴性结果可能会出现在任何分子检测的检测SARS-CoV-2如果突变发生在病毒的基因组评估测试的一部分。”
B.1.1.7变种,主要关注的领域是S基因的测试目标。“实验室使用的分析目标的蛋白质应审查性能密切注意假阴性结果,“Kothandaraman评论。测试目标等病毒的基因组区域ORF1ab基因和信封(E)基因不受S基因突变的影响,所以他们的表现对B.1.1.7变种不应减少。
因为大多数SARS-CoV-2 PCR测试使用多个基因的目标而不是一个目标,B.1.1.7变体的影响诊断没有预期到的人是重要的。它也被FDA的建议检测模式测试目标S基因,除了其他目标,有助于早期识别病人的新变种。样品展示S基因辍学可以进一步的特点是基因测序。
什么影响其他诊断方法的变种,如用于快速大规模筛查?大多数抗原检测目标的N蛋白的糖基由N基因编码,所以应该最低限度的影响。英国公共卫生报告,评估确认横向流装置是有效的在检测B.1.1.7变种,虽然所有设备测试工作通过检测N而不是蛋白质。抗体检测的性能尚未评估,但化验检测抗体的蛋白质可能会受到影响。
除了B.1.1.7,其他SARS-CoV-2变异是在全球范围内传播,包括B.1.351,首次发现在南非,和第1页,首次发现在四个旅行者来自巴西。很可能进一步变异的兴趣将会出现,可以看到在其他领域的引入突变的基因,可能会影响当前的性能诊断方法等对策。许多诊断供应商积极监测SARS-CoV-2变体,以确保他们的测试是有效的,通过分析病毒基因序列和测试实际样品。
“英国和南非变异病毒进化的两个实例。科学界将继续跟踪突变,研究病毒进化和调整测试,相应的治疗和疫苗,”Kothandaraman总结道。
总经理Arvind Kothandaraman、专业诊断PerkinElmer,安娜·麦克唐纳说,科学技术网络作家。188金宝搏备用
