击中的目标总会在进步

今年的基因组生物学和技术的进步(AGBT)会议展示了一些最令人兴奋的发展基因技术。扭转生物科学专门从事DNA合成,展示了他们的新目标浓缩的解决方案在今年的会议。我们赶上了捻首席执行长艾米丽Leproust讨论目标的重要性在下一代测序(上天)和浓缩领域进步在AGBT引起了她的注意。

Ruairi Mackenzie (RM):门店工作流目标浓缩为什么重要?

艾米丽Leproust (EL):目标浓缩的目的是使测序尽可能高效。目标浓缩使研究人员集中研究特定的基因变异。客户使用目标浓缩简化他们的实验室工作流和数据分析。目标浓缩的一个关键好处是它使实验室处理更多的样品在一个测序仪器相比,全基因组测序。目标浓缩是重要的极低频率的检测颗粒DNA样本的变异使用。

我们相信,我们是唯一一家提供双链DNA (dsDNA)探测器在一个综合目标浓缩设备用于外显子组测序和有针对性的。使用dsDNA与单链DNA或RNA,下一代测序准备期间可能避免脱氨基作用的问题(删除一个氨基)。脱氨基作用干扰罕见的基因突变的检测,并可能阻碍基因结果和临床诊断,尤其是癌症。

莫莉·坎贝尔(MC):具体如何捷目标浓缩生产线加速杂交?使其发展什么技术?

埃尔:扭曲的门店目标浓缩工作流使客户从样品测序仪在一天之内。扭曲的快速杂交和清洗设备是一种新的系统设计节省时间和提高性能。一个高度优化的缓冲系统降低杂交时间15分钟。所有目标排序的快速杂交工作流是理想的应用程序,包括全外显子组和自定义面板。

RM:转折如何使用数据来驱动它的面板设计过程?

埃尔:在扭转,我们的基础是应用工程原则面板开发和设计。我们采用了迭代学习方法优化目标浓缩的设计。我们的硅基寡核苷酸生产过程为我们提供了快速生成许多门店面板的能力。在我们的产品开发过程中,我们应用这种迭代方法构建和测试多个面板设计为一个特定的应用程序或目标区域。使用这种技术,我们可以准确地预测哪些目标捕获探针将表现良好,哪些调查不应包括在设计。我们与我们的研发团队和客户紧密合作,通过实验验证我们的设计,继续提供最佳性能,并使新的应用程序。

MC:在小说门店产品的开发,从科学家在这个领域,有输入最终将使用这些产品?

埃尔:输入来自科学界和我们的客户是一个重要的考虑产品开发在转折。例如,我们的客户告诉我们,他们希望能够完成整个工作流目标浓缩在一个工作日。这是特别重要的客户运行的大型实验室流程每年成千上万的样品。反馈帮助进一步鼓励我们的开发和推出的转折快速杂交和清洗设备。另一个关键的好处与科学家在这个领域密切合作,收集了解门店中的下一个应用程序。通过与客户的紧密合作,捻度可以继续做出创新贡献前沿科学研究。

RM:应用和创新在AGBT门店今年让你印象深刻吗?

埃尔:AGBT提供了一个很好的展示最新的创新挥动。在2019年,有几个明显的趋势和重大创新领域。一个主题贯穿会议是需要高质量的工具,可以应用到临床应用。上天已经迅速从实验室到临床研究。这一趋势将继续推动技术创新。在新技术方面,高通量测序仪器的发展使得新门店的科学问题需要解决。大规模的单细胞研究的规模和重要性正日益增强。空间基因组学是一个新兴技术,正越来越多地用于immune-oncology应用程序。

艾米丽Leproust莫莉坎贝尔和Ruairi J Mackenzie说,科学技术网络作家188金宝搏备用