自动化如何在“大辞职”中帮助避免下一代测序错误

对人工测序和重现性挑战的担忧出现在科学和大众媒体上。科学中有许多促成因素和受影响的学科，但需要高度重视的是减少人为错误作为获得高质量下一代测序(NGS)研究数据的一个因素。

NGS文库准备——从样本中创建条形码DNA片段进行测序的过程——是劳动密集型的，手动执行时容易出错，更不用说实验室工作人员的潜在倦怠了。的复杂性和严格的本质准备NGS库他们在质量控制方面投入的资源强调了这一点:似乎每隔几步，你都要检查核酸浓度、产量、片段大小和纯度。

自动化有助于克服哪些错误?

在图书馆准备环境中手动处理液体的能力需要练习和耐心。即便如此，绘制并准确分配不同粘度的小体积液体并不容易，混合含有洗涤剂的缓冲液而不产生气泡，反复清洗微小的珠子但又不太容易被洗掉。

我永远不会忘记我第一次在图书馆备课的经历．我的导师正在做ChIP-Seq实验，他让我帮忙。由于我已经做了数百个PCR和克隆实验，我对自己的能力很有信心，可以自己遵循协议，但我的导师希望我们同时准备一组:终极测试!尽管我有经验，但我还是能听到她的喘息声，因为我洗珠子的时候有点太用力了。她开始更仔细地观察我，并指出各种各样的错误——从我靠在试剂上的方式，那是非常昂贵的，到我喷射移液器尖端的方式，那可能污染了整个三楼!最后，我们在生物分析仪上检查了我们的进展。让我非常尴尬的是，我的样品有一半完全消失了，剩下的都是大小可疑的碎片。这是一个关于自动化价值的快速教训!

即使是对那些在图书馆准备方面最有经验的人来说，准备的步骤之多，乘以一周内所做的准备工作的数量，在统计上也足以保证会犯错误。我的老板也不例外。

然而，以一种万无一失、易于使用的方式自动化图书馆准备不仅仅是液体处理．它需要工作空间规划以及帮助消除另一个常见错误的策略:交叉污染。观察经验丰富的技术人员对图书馆的准备工作，你会注意到他们首先会在工作空间内安排实验室用具和试剂，以减少污染的可能性。然后看着他们小心翼翼地在工作区周围移动移液器的尖端，以防止任何意外滴下的液体污染下面干净的管子。

我们设计的Biomek NGeniuS下一代图书馆准备系统*考虑到这种谨慎的工作空间管理。我们开发了一个精心布置的甲板，以及一个名为Dynamic DeckOptix的光学分析系统。该系统与仪器后内壁的平视显示器相结合，在用户设置要运行的批处理时，为他们提供实验室仪器放置的实时反馈。

NGS库准备如何保持足够的灵活性，以便与不同的库准备套件很好地工作，并且仍然是万无一击的?

在引入Biomek NGeniuS系统之前，我们很难找到NGS自动化的“最佳点”对于那些愿意牺牲协议灵活性的人来说，有ngs专用的自动化工具可用，但它们往往会将你锁定在一种特定的库准备化学物质或方法上。如果你想保持使用不同库准备化学物质和方法的灵活性，你必须牺牲易用性，使用通用液体处理系统创建一个定制的自动化工作流程，这需要广泛的自动化专业知识。

除了实验室用品放置验证，DeckOptix系统还提供其他护栏，以帮助确保成功的准备工作。例如，它会检查盖子，确保执行演示方法所需的实验室工具库存，并自动为音量选择正确的尖端。然而，我最喜欢的防傻瓜功能是它能够读取试剂标签，包括大多数手写标签。用户只需加载试剂传送带，让系统识别它们。每一种试剂都经过验证，以匹配所选的批处理方案，并自动保持在适当的温度。正是这一特性使Biomek NGeniuS系统能够灵活地与大多数商业图书馆准备套件和方法一起工作。

该特性还有助于排除故障时的猜测。如果你曾经解决过一次失败的准备工作，想知道你是否使用了错误的酶，或者你的样品是否由于储存不当而被毁了，这可能也是你最喜欢的功能。

图书馆准备工作自动化如何帮助我们驾驭“大辞职”，并提高实验室的士气?

大流行期间，各种规模和学科的实验室都在努力保持生产力。保持社交距离的要求和设施关闭，迫使习惯于肩并肩工作的实验室工作人员接受轮班，在家里做他们能做的任何工作。毫无疑问，疫情激发了人们对远程自动化的兴趣。

Biomek NGeniuS系统可同时远程操作一台或多台仪器。与温度-控制试剂存储，该系统可以运行一夜。它还具有集成的热循环器，以帮助延长那些需要它的准备协议的步行时间。

科学家和技术人员对改善全球健康和福祉充满热情，并有动力看到个性化医疗研究的前景得以实现。虽然人们对自动化大大减少图书馆准备错误的能力非常赞赏，但也许更大的赞赏是它可以让他们专注于研究、设计新方法或开发新的生物标记物面板的额外时间。

将自动化引入需要大量手工图书馆准备工作的实验室，可以通过让他们专注于工作，从而积极地提高士气和员工保留率研究，而不是研究工作流程。

*Biomek NGeniuS Next Generation Library Prep Systems不用于疾病或其他疾病的诊断。在发展。性能特征尚未验证。

在Biomek NGeniuS下一代库准备系统中使用的每个应用程序模板都已演示，但尚未得到贝克曼库尔特的验证。贝克曼库尔特不对应用程序模板作出任何形式的明示或暗示的保证，包括但不限于对特定用途的适用性或适销性或应用程序模板不侵权的保证。所有保证均明确拒绝。您使用任何应用程序模板的风险完全由您自己承担，不向贝克曼库尔特求助。

产品和演示的应用程序不用于诊断程序，也不经过验证。

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