表观遗传学优化细胞培养条件下驾驶和维护细胞的身份

作为正在进行的努力的一部分改变细胞疗法的发展,Mogrify®最近推出了EpiMOGRIFY,扩展的公司专有的直接细胞转换技术。通过建模一个细胞的表观遗传状态,平台可以预测最优培养条件对细胞的维护和转换。

188金宝搏备用Mogrify与皮埃尔-路易斯Joffrin、企业发展总监,了解更多关于EpiMOGRIFY平台,使用的优点数据驱动的方法来维持细胞的身份和支持细胞转换,和这可能影响细胞疗法的发展。

莫莉·坎贝尔(MC):为什么它是重要的是能够模型细胞的表观遗传状态的背景下发展中细胞疗法?

皮埃尔-路易斯Joffrin (PJ):几乎在人体内每一个细胞都包含相同的基因组成,但每个细胞都有一个独特的方式利用这些内容通过基因修饰符(表观遗传学),差异基因活化剂(如转录因子)和蛋白质表达。通过研究基因的修改,比如H3K4me3组蛋白的修改,我们可以学到哪些基因表达和驱动一个特定细胞的身份。

EpiMOGRIFY的案例中,我们运用这些知识来确定最佳的细胞培养条件以提高细胞转换或维持细胞化学定义媒体的身份。这可以应用于成熟的靶细胞的类型和随后的cGMP制造支持可伸缩的现成的疗法的发展。

主持人:EpiMOGRIFY平台是如何工作的呢?

PJ:EpiMOGRIFY结合基因调控信息的模型细胞的表观遗传景观和利用DNA-histone甲基化水平的变化。平台利用数据来自100多个人类细胞/组织类型(可以通过编码和表观基因组路线图财团)和包含蛋白质交互(PPI)网络信息来识别细胞胞内受体驾驶身份。因此,媒体组件,来激活这些受体,可以用来优化培养条件,维持细胞身份或诱导细胞转化。

研究支撑最近发表在这本小说的计算方法电池系统(Kamaraj et al ., 2020)。

主持人:平台措施组蛋白修饰是表观遗传机制的一个例子。EpiMOGRIFY考虑其他可能的机制在起作用吗?

PJ:EpiMOGRIFY认为两个不同的组蛋白修饰:H3K4me3组蛋白活性基因和修改标签H3K27me3组蛋白修饰的沉默基因。PPI网络信息然后将排名结果基于监管影响细胞的身份。

安娜·麦克唐纳(上午):为什么需要文化细胞化学定义条件?

PJ:化学定义文化条件对于细胞的生存是必要的在体外。通过优化培养条件,我们能够复制细胞的原生在活的有机体内细胞微环境支持和鼓励承担特定的转换或保持其身份。结果,我们能增强细胞的数量和质量支持的发展更加可伸缩和可访问细胞治疗指征高未满足临床需要的血液,免疫学、眼科等疾病领域。

问:是什么让它如此具有挑战性的确定最佳培养条件的维护细胞识别或促进细胞转化?

PJ:细胞是复杂和动态;他们与周围的细胞相互作用,应对环境因素和发送自动调节的反馈信号。为了模拟在活的有机体内例如条件,细胞培养需要考虑组件的培养基和细胞类型特异的因素的。这是一个巨大的组合空间的可能性考虑所有的已知的增长因素和其他可能的媒体组件。如果条件不正确,细胞可能获得不受欢迎的品质或可能会死。

问:如何EpiMOGRIFY平台与其他现有方法?

PJ:细胞培养条件历来是决定通过试错了几十年的实验。EpiMOGRIFY可以系统地介绍了一种数据驱动的方法预测表观遗传开关来维持细胞和支持细胞转换。

在电池维护和分化,EpiMOGRIFY定义条件执行,或者更好的在所有情况下相比,现有的未定义的条件下,显著增加细胞的生长和生存,以及导致更高的分化效率。

问:你有什么计划来扩展的特性EpiMOGRIFY平台?

PJ:EpiMOGRIFY已经是我们专有的直接细胞转换技术的延伸,MOGRIFY®(代替et al。,自然遗传学,2016)。这些专有平台的不断演化可能会看到包含额外的转录组和表观遗传数据集(如小分子核糖核酸和乙酰化作用),进一步提高预测精度和改善系统的转换和维护任何细胞类型的能力。

细胞疗法的上下文中,有潜力开发新的细胞类型疾病的治疗与未满足的医疗需求,引入一个替代来源的细胞克服安全问题(如。致瘤性的干细胞),或一个新阶层的先锋在活的有机体内重组疗法通过小分子的识别。