确定基因组的3D结构揭示了染色体区域之间的空间相互作用。这一关键信息可用于基因组搭建或了解染色体结构如何影响基因表达。Pore-C是一个端到端的染色质构象捕获工作流,使用牛津纳米孔平台来揭示3D染色体拓扑结构。
在本次网络研讨会上,纽约大学的Jae Young Choi博士将讨论如何在植物物种中进行Pore-C测序,以生成染色体水平的基因组组装,并绘制染色质相互作用,以确定候选增强子-基因相互作用。
- 纳米孔测序技术如何用于植物基因组测序和组装
- 如何应用三维染色体构象捕获技术获得染色体水平的基因组组装
- 如何利用基于纳米孔测序的染色体接触数据来推断基因组中的染色质调控