一个真正的多路复用的解决方案很快准备挥动库从几百美元到几千样本。我们的简单和可伸缩Tn5 transposase-based工作流提供了更大的一致性下游样本和更少的处理步骤。
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多路1000的样品轻松使用我们的工具。
内置的规范化与每一个工具包。
均匀插入大小和样本读计数。
提高了测序的总体性能。
第一个概念验证实验的seqWell酶存储缓冲区,和我们做了多个稀释看到哪一个最好的工作。我们把最好的稀释,使UDiTaS库和测序。seqWell 1:2稀释酶表现最好的。我们有类似的叙述,中等大小图书馆是一样的,我们有大于85%的读取调整到目标。(Tagify)批次是一致的,他们提供类似tagmentation概要文件和编辑的结果。反应可以按比例缩小的井从96年到384年,我们已经能够处理成千上万的反应超过一年。我们可以看到很好的再现性跨批次(Tagify)。
从其他公司与全天参与协议,简单的seqWell工作流允许更多的吞吐量,即使没有使用昂贵的机器人。seqWell工作流也增加的准确性通过提供独特的样本索引一开始没有增加指数跳的机会。失败的样品的数量要低得多,节省时间,金钱,和潜在的标签错误造成的重复实验。我们看到一个以前75%的成功率,但观察到的巨大改进。我们现在有一个与seqWell 95 - 99%的成功率。
比桑格ExpressPlex就是快。这为我们改变了一切。基本上,一天两天的过程大大缩短时间数据。现在只是一步,然后我们把它传输到图书馆。我们可以民主化,人们可以运行它。这一天缩短的过程给了我们两个的曲柄而不是一个在任何给定的实验。这是巨大的。
为了采取这样一个比例增大的努力跟踪的出现和散度SARS-CoV-2在纽约州,我们必须确定最佳的浓缩PCR协议,所以我们做了大量的搜索。我们看了看,发现汽车列车v3协议使用seqWell plexWell方法和我们似乎极具吸引力,因为可伸缩性。它实际上使我们实现低风险、中度风险和更高的吞吐量。就不可能没有采用可伸缩技术plexWell平台。
seqWell技术已经显著提高效率,减少操作时间的QC和稀释cDNA、除了池的样品在早期的计算过程。plexWell快速单细胞装备了高质量的单细胞图书馆可行的准备常规的实验室,而不是使用替代方法一项艰巨的任务。我们的经验导致plexWell单细胞的实现方法的核心设施,扩大他们的能力来支持分析单细胞决议在我们的研究所。
综合auto-normalization plexWell工具包允许我们把96个样本作为一量子位测量得到的平均浓度输入板,一个管过程在图书馆准备,一个库池和加载到爱尔兰iSeq正常化。plexWell工具包的这是一个巨大的优势,因为它消除了需要个人输入DNA纯化和个体样本归一化。
使用plexWell LP 384的关键好处是节省时间的图书馆准备和简单的清理与其他方法相比。能够创建一个图书馆在两天内让我们扩大样本的数量我们处理。
我们有许多不同种类的样品,如蜻蜓,山猫,岩鱼。plexWell LP 384工具包是灵活的大多数物种我们正在与与低输入量对濒危物种很重要。
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