第一个基因组序列濒危鲨鱼发表

这是一个惊人的图像描述保护鲨鱼的科学的一个里程碑。Shivji教授迈克尔·斯坦霍普教授和他们的合作者回望历史上通过测序染色体水平的基因组(整个基因蓝图)伟大的锤头和头灰鲭鲨。他们的DNA时间表显示,超过250000年他们的人口大幅下降。科学家们也发现令人担忧:伟大的槌头双髻鲨遗传变异较低,这使得他们适应快速变化的世界的弹性较小。近亲繁殖的物种也表明了,这个问题可以降低其种群生存的能力。然而,头灰鲭鲨显示更高的多样性和有限的近亲繁殖,一个充满希望的悲观保护气候闪闪发光。理解变化如此大时间尺度可以放到上下文这些濒危动物的保护现状。结果可以帮助我们直接向更多微妙的鲨鱼的管理策略。

研究结果发表在一篇论文中iScience:基因组的濒危伟大的锤头,头灰鲭鲨揭示历史人口下降和高水平的近亲繁殖的锤头的由康奈尔大学的斯坦霍普教授和教授Shivji,拯救我们的海洋基金会鲨鱼研究中心主任和盖哈维研究所,诺瓦东南大学,康奈尔大学的合作者,诺瓦东南大学、天普大学,州长州立大学和圣地亚哥动物园野生动物联盟。科学家获得并组装的整个基因组序列的伟大的锤头,头灰鲭鲨和比较基因组和基因组信息的鲸鲨,白鲨,brownbanded竹子鲨鱼和多云的猫。他们的方法读起来像复杂puzzle-building科学侦探:先后从微小的DNA片段组装不同序列拼接的挂毯,细节生活的蓝图。达到染色体水平代表了最新的高质量的全基因组序列研究——和一个棘手的壮举来实现物种如鲨鱼,巨大的基因组。

推进技术的应用是为鲨鱼和鳐鱼在荒凉的报告。

“技术进步意味着基因组DNA测序方法的研究更强大和有效的现在”,斯坦霍普教授说。“我们可以应用这些新技术对生物体获得的见解,我们希望可以利用的信息保护鲨鱼和鳐鱼”。

虽然我们不知道鲨鱼近亲繁殖的影响,发现狼和猎豹显示有问题的特征可以在随时间的蠕变。结果往往是降低物种的生存。大槌头双髻鲨的照片——过度捕捞和交易的鳍,令人担忧。但没有这些关键基因的见解,我们将无法修改他们的弱势群体目前如何管理。

研究人员谨慎夸大的结果。

遗传学等先进,染色体基因组水平的期望参考质量基因组物种。然而,保育研究一致地呈现自己的挑战来实现这一决议将在其他领域”。Shivji教授补充说:“从濒临灭绝的海洋脊椎动物获取组织样本是一个主要的障碍。可以组装基因组与一个组织样本从一个鲨鱼,但最理想的情况是来自多个个体的基因组序列从不同部位的海洋范围,一种道德困难和昂贵的努力。”

事实上,研究人员状态这是当前研究的一个限制。伦理的局限性与濒危物种意味着保护遗传学家必须平衡的最新进展对脆弱人群他们的研究。除了揭示的遗传多样性和脆弱地位两个濒危鲨鱼,研究人员希望他们的研究结果将提供他们reference-quality基因组,未来的基础科学可以构建以提高我们对鲨鱼的了解。当然,当出现新的可能性,我们洞察鲨鱼的蓝图将帮助加强我们的理解这些生态重要物种和保护弱势群体。

参考:印刷机的乔丹,谷神星公里,太阳问,等。基因濒危的锤头和头灰鲭鲨揭示历史人口下降和高水平的近亲繁殖的锤头。iScience。2023年,26 (1)。doi:10.1016 / j.isci.2022.105815

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