考拉第一次的基因组测序

澳大利亚和国际的一个科学家小组,共同由澳大利亚博物馆研究所和悉尼大学,完成了学界的考拉基因组测序。

被认为是迄今为止最完整的有袋类动物基因组测序,在质量上与人类基因组持平。高度精确的基因组数据将为科学家提供新的信息,通知保护工作,有助于疾病的治疗,并有助于确保考拉的长期生存。

该财团的研究——包括54科学家来自29个机构7个国家,超过34亿个碱基对,测序考拉基因组中超过26000个基因;考拉基因组是比人类基因组。

打开基因组序列给科学家前所未有的见解独特的生物学考拉。

考拉基因组联盟宣布建立项目在2013年首次未装配的基因组草案。集体的目标是引导他们的研究确保长期生存的重要的有袋类动物,同时增加澳大利亚的基因组功能。

从那时起,研究人员组装这个大袋基因组到最完整和准确的有袋类动物基因组日期和注释它的26000个基因进行分析。

考拉的基因组已经测序准确性95.1%,相比较,人类基因组。澳大利亚与国际的一个科学家小组,由丽贝卡·约翰逊教授,澳大利亚博物馆馆长研究所教授凯瑟琳·别洛夫悉尼大学,取得了重大突破成功测序基因组完整的考拉,研究结果发表在自然遗传学。

被认为是迄今为止最完整的有袋类动物基因组测序,在质量上,与人类基因组。高度精确的基因组数据将为科学家提供新的信息,通知保护工作,有助于疾病的治疗,并有助于确保考拉的长期生存。

“考拉基因组联盟一直是一个雄心勃勃的旅程提供我们伟大的见解遗传构建块组成一个考拉——一个澳大利亚的,以及世界上,最有魅力和标志性的哺乳动物,”约翰逊教授说。

“这里程碑已经从我们的视野来利用基因组学来保护这一物种。基因蓝图不仅出土大量的数据关于考拉不寻常的和高度专业化的桉树叶的饮食,但也提供了重要的洞察他们的免疫系统,种群多样性和考拉的进化,”她说。

澳大利亚科学家领导的财团由54科学家来自29个不同机构在七个国家。他们有超过34亿个碱基对,超过26000个基因测序在考拉基因组中,这使得它比人类基因组。打开基因组序列给科学家前所未有的见解独特的生物学考拉。

约翰逊教授说考拉种群在整个范围内的不平衡响应大规模管理面临的主要挑战之一的物种。

“基因组使全面和科学的考拉保护接地方法,”她说。“澳大利亚最高的哺乳动物灭绝任何国家在人类世的记录。

“考拉数量暴跌以来范围北部地区的欧洲殖民,但增加了一些南方地区,尤其是在维多利亚州和南澳大利亚。”

董事兼首席执行官,澳大利亚博物馆,金正日麦凯,AO祝贺约翰逊教授和团队这一成就。

“今天我们庆祝完成最高质量的,有袋类动物基因组测序进行更新。这项工作是通过细致的努力不仅带来别洛夫约翰逊教授和教授,但也从其他澳大利亚博物馆的科学家的贡献,以及来自全国各地的科学家和世界。它将开创一个新时代的我们的理解和保护标志性的考拉,”她说。

遗传学教授Jennifer坟墓,AO,特聘教授,拉筹伯大学和2017点奖得主科学,说:“我们根本无法想象,当我们开创性的考拉遗传学在1980年代,有一天我们会整个考拉基因组序列。这开辟了各种方式我们可以监视考拉种群的基因健康。”

考拉基因组联盟宣布建立项目在2013年首次未装配的基因组草案。集体的目标是引导他们的研究确保长期生存的重要的有袋类动物,同时增加澳大利亚的基因组功能。

从那时起,研究人员不知疲倦地致力于将这个基因组组装成最完整和准确的有袋类动物基因组日期和注释它的26000个基因进行分析。考拉的基因组已经测序的准确性为95.1%,相比较,人类基因组。

发表的34亿个碱基对考拉基因组被测序Ramaciotti基因组学中心,新南威尔士大学,使用新的测序技术。

“然后我们组装基因组与超级计算机,允许该财团然后研究> 20000个基因这一独特的物种,”马克·威尔金斯教授说,导演,Ramaciotti基因组学中心,新南威尔士大学。

联盟成员的厄勒研究所(EI),(英国诺里奇)发现,考拉有两个大扩张的基因家族已知积分解毒,代谢酶的细胞色素P450基因家族。他们发现这些基因表达在很多考拉组织,特别是在肝脏;说明他们有一个非常重要的解毒功能,可能使考拉成为饮食专家。

约翰逊教授解释说,“这可能帮助他们找到适合自己的生存,因为他们可能依赖于一个食物来源,缺乏来自其他物种的竞争不能够作为有效解毒。”

衣原体引起不孕和失明和严重影响了考拉种群在新南威尔士和昆士兰。使用获得的信息从考拉基因组,科学家们希望开发一种疫苗抗衣原体感染等疾病。

最危险的过程通过开荒考拉的生存栖息地的丧失和城市化导致栖息地的减少连接,减少了遗传多样性和高危考拉的近亲繁殖。近亲繁殖的结果可以是非常有害的考拉种群的生存,因为它会导致遗传多样性降低。

约翰逊教授补充说:“第一次使用超过1000个基因与标记,我们能够表明,新南威尔士和昆士兰的数量显示显著的遗传多样性水平和长期的跨区域连接。

“保证遗传多样性是守恒的协同与其他保护措施,保护栖息地,减少车辆罢工,狗攻击和疾病,是考拉的长期生存的关键。”

本文从提供的材料已经再版悉尼大学。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。

参考:约翰逊,r . N。'Meally阿,D。陈,Z。-埃瑟林顿,g . J。Ho,郑胜耀W。纳什,w·J。…别洛夫,k (2018)。适应和保护考拉基因组的见解。自然遗传学,1。https://doi.org/10.1038/s41588 - 018 - 0153 - 5