有些人携带的DNA来自一个古老的未知祖先
一项对古代基因组的新分析表明，人类家族树的不同分支曾多次杂交，一些人携带的DNA来自一个古老的、未知的祖先。康奈尔大学的Melissa Hubisz和Amy Williams以及冷泉港实验室的Adam Siepel在一项研究中报告了这些发现公共科学图书馆遗传学。
大约5万年前，一群人类走出非洲，在欧亚大陆与尼安德特人杂交。但这并不是我们的远古人类祖先和他们的亲戚交换DNA的唯一一次。对尼安德特人和一个不太知名的古代群体丹尼索瓦人的基因组测序，对这些异种繁殖事件和古代人类种群的迁徙产生了许多新的见解。
在这篇新论文中，研究人员开发了一种分析基因组的算法，可以识别来自其他物种的DNA片段，即使这种基因流发生在数千年前，来自一个未知的来源。他们使用该算法研究了两名尼安德特人、一名丹尼索瓦人和两名非洲人的基因组。研究人员发现证据表明，尼安德特人的基因组有3%来自古人类，并估计这种异种繁殖发生在20万至30万年前。此外，1%的丹尼索瓦人基因组可能来自一个未知的、更遥远的亲戚，可能是直立人，而大约15%的这些“超级古老”的区域可能已经遗传给了今天活着的现代人。
新的发现证实了先前报道的古人类与其亲属之间基因流动的案例，也指出了异种繁殖的新实例。考虑到这些事件的数量，研究人员说，每当两个群体在时间和空间上重叠时，基因交换就可能发生。他们的新算法解决了一个具有挑战性的问题，即识别几十万年前发生的基因流的微小残余，当时只有少数古代基因组可用。这种算法也可以用于研究发生杂交的其他物种的基因流，比如狼和狗。
作者亚当·西佩尔说:“我认为这项工作令人兴奋的地方在于，它展示了通过联合重建现代人和古人类的完整进化史序列，你可以了解到深刻的人类历史。”“梅丽莎开发的这种新算法，ARGweaver-D，比我见过的任何其他计算方法都能追溯到更久远的时间。它似乎在探测古代的渗透方面特别强大。”
参考:Hubisz, Williams和Siepel。(2020)。通过人口统计学意识推断祖先重组图绘制古人类之间的基因流。公共科学图书馆遗传学。DOI: 10.1371 / journal.pgen.1008895。
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