WGS揭示体内CRISPR基因编辑的潜在陷阱
随着CRISPR-Cas9开始进入临床试验,一项新的研究发表在《自然方法发现,基因编辑技术可以引进数百意想不到的突变基因。
“我们觉得它是至关重要的,科学界认为所有不相干的突变引起的潜在危险CRISPR,包括单核苷酸突变和变异在基因组的非编码区域,”合著者斯蒂芬曾说,医学博士,博士,Laszlo t .鱼毒木眼科副教授和病理学副教授&基因组医学研究所细胞生物学和人类营养研究所的哥伦比亚大学医学中心。
CRISPR-Cas9编辑技术的速度和前所未有的精确,是有利于科学家们试图了解基因疾病的作用。这项技术也提出了希望更强大的基因疗法,可以删除或修复有缺陷的基因,不仅添加新的基因。
第一个临床试验部署CRISPR现在开始在中国,和美国的审判定于明年开始。但即使CRISPR能准确瞄准特定的DNA,它有时基因组的其他部分。大多数研究寻找这些不相干的变异使用计算机算法来识别领域最有可能受到影响,然后分析这些地区进行删除和插入。
“这些预测算法似乎做好当CRISPR在培养皿中在细胞或组织执行,但全基因组测序并没有被用来寻找脱靶效应在活的动物,”合著者说亚历山大Bassuk医学博士,爱荷华大学的儿科教授。
在新的研究中,研究人员小鼠的整个基因组测序,此前曾接受过CRISPR基因编辑团队的研究和寻找所有突变,包括那些只改变一个核苷酸。
研究者确定CRISPR已经成功地纠正基因导致失明,但凯莉Schaefer Vinit Mahajan实验室的博士生,医学博士,博士,副教授斯坦福大学眼科研究的合著者,发现两个独立的基因组基因疗法收件人已经持续超过1500单核苷酸突变和100多个大的删除和插入。这些DNA突变被广泛使用的计算机算法预测人员寻找脱靶效应。
“研究人员没有使用全基因组测序发现脱靶效应可能错过潜在重要的突变,”曾荫权博士说。“即使单核苷酸的变化可以产生巨大影响。”
Bassuk博士说,研究人员没有发现任何与他们的动物显然错误的。说,“我们仍然看好CRISPR Mahajan博士。“我们是医生,我们知道每一个新的治疗有潜在的作用,但是我们需要知道它们是什么。”
研究人员目前正在努力改善的组件CRISPR体系以其gene-cutting酶和酶RNA指导正确的基因提高编辑的效率。
“我们希望我们的发现将鼓励其他人使用全基因组测序的方法来确定所有的脱靶效应CRISPR技术和研究不同版本最安全、最精确的编辑,”曾荫权博士说。
这篇文章被转载材料所提供的哥伦比亚大学医学中心。注:材料可能是长度和内容的编辑。为进一步的信息,请联系引用源。
参考
Schaefer,凯莉et al。“意想不到的突变CRISPR-Cas9编辑后体内”。自然方法14.6 (2017):547 - 548。网络。
